Protein–RNA interactions for Protein: D3YYB5

Gm42791, Predicted gene 42791 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm42791D3YYB5 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm42791D3YYB5 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm42791D3YYB5 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm42791D3YYB5 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm42791D3YYB5 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm42791D3YYB5 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm42791D3YYB5 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm42791D3YYB5 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm42791D3YYB5 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm42791D3YYB5 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm42791D3YYB5 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm42791D3YYB5 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm42791D3YYB5 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm42791D3YYB5 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gm42791D3YYB5 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gm42791D3YYB5 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm42791D3YYB5 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm42791D3YYB5 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm42791D3YYB5 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm42791D3YYB5 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm42791D3YYB5 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm42791D3YYB5 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm42791D3YYB5 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm42791D3YYB5 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm42791D3YYB5 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm42791D3YYB5 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm42791D3YYB5 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm42791D3YYB5 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm42791D3YYB5 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm42791D3YYB5 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm42791D3YYB5 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm42791D3YYB5 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gm42791D3YYB5 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm42791D3YYB5 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm42791D3YYB5 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm42791D3YYB5 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm42791D3YYB5 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm42791D3YYB5 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm42791D3YYB5 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm42791D3YYB5 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm42791D3YYB5 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gm42791D3YYB5 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gm42791D3YYB5 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm42791D3YYB5 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm42791D3YYB5 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gm42791D3YYB5 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gm42791D3YYB5 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gm42791D3YYB5 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gm42791D3YYB5 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm42791D3YYB5 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm42791D3YYB5 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm42791D3YYB5 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gm42791D3YYB5 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gm42791D3YYB5 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm42791D3YYB5 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm42791D3YYB5 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Gm42791D3YYB5 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gm42791D3YYB5 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gm42791D3YYB5 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gm42791D3YYB5 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gm42791D3YYB5 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gm42791D3YYB5 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm42791D3YYB5 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm42791D3YYB5 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Gm42791D3YYB5 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gm42791D3YYB5 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gm42791D3YYB5 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gm42791D3YYB5 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gm42791D3YYB5 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gm42791D3YYB5 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gm42791D3YYB5 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gm42791D3YYB5 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gm42791D3YYB5 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gm42791D3YYB5 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Gm42791D3YYB5 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Gm42791D3YYB5 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gm42791D3YYB5 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gm42791D3YYB5 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gm42791D3YYB5 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Gm42791D3YYB5 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Gm42791D3YYB5 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gm42791D3YYB5 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gm42791D3YYB5 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gm42791D3YYB5 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gm42791D3YYB5 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gm42791D3YYB5 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gm42791D3YYB5 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Gm42791D3YYB5 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gm42791D3YYB5 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gm42791D3YYB5 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gm42791D3YYB5 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gm42791D3YYB5 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gm42791D3YYB5 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gm42791D3YYB5 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gm42791D3YYB5 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gm42791D3YYB5 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gm42791D3YYB5 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gm42791D3YYB5 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gm42791D3YYB5 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gm42791D3YYB5 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 114.2 ms