Protein–RNA interactions for Protein: D3YXE9

BC048679, cDNA sequence BC048679, mousemouse

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC048679D3YXE9 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
BC048679D3YXE9 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
BC048679D3YXE9 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
BC048679D3YXE9 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
BC048679D3YXE9 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
BC048679D3YXE9 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
BC048679D3YXE9 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
BC048679D3YXE9 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
BC048679D3YXE9 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
BC048679D3YXE9 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
BC048679D3YXE9 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
BC048679D3YXE9 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
BC048679D3YXE9 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
BC048679D3YXE9 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
BC048679D3YXE9 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
BC048679D3YXE9 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
BC048679D3YXE9 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
BC048679D3YXE9 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
BC048679D3YXE9 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
BC048679D3YXE9 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
BC048679D3YXE9 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
BC048679D3YXE9 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
BC048679D3YXE9 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
BC048679D3YXE9 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
BC048679D3YXE9 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
BC048679D3YXE9 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
BC048679D3YXE9 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
BC048679D3YXE9 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
BC048679D3YXE9 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
BC048679D3YXE9 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
BC048679D3YXE9 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
BC048679D3YXE9 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
BC048679D3YXE9 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
BC048679D3YXE9 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
BC048679D3YXE9 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
BC048679D3YXE9 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
BC048679D3YXE9 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
BC048679D3YXE9 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
BC048679D3YXE9 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
BC048679D3YXE9 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
BC048679D3YXE9 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
BC048679D3YXE9 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
BC048679D3YXE9 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
BC048679D3YXE9 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
BC048679D3YXE9 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
BC048679D3YXE9 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
BC048679D3YXE9 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
BC048679D3YXE9 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
BC048679D3YXE9 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
BC048679D3YXE9 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
BC048679D3YXE9 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
BC048679D3YXE9 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
BC048679D3YXE9 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
BC048679D3YXE9 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
BC048679D3YXE9 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
BC048679D3YXE9 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
BC048679D3YXE9 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
BC048679D3YXE9 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
BC048679D3YXE9 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
BC048679D3YXE9 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
BC048679D3YXE9 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
BC048679D3YXE9 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
BC048679D3YXE9 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
BC048679D3YXE9 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
BC048679D3YXE9 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
BC048679D3YXE9 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
BC048679D3YXE9 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
BC048679D3YXE9 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
BC048679D3YXE9 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
BC048679D3YXE9 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
BC048679D3YXE9 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
BC048679D3YXE9 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
BC048679D3YXE9 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
BC048679D3YXE9 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
BC048679D3YXE9 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
BC048679D3YXE9 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
BC048679D3YXE9 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
BC048679D3YXE9 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
BC048679D3YXE9 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
BC048679D3YXE9 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
BC048679D3YXE9 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
BC048679D3YXE9 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
BC048679D3YXE9 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
BC048679D3YXE9 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
BC048679D3YXE9 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
BC048679D3YXE9 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
BC048679D3YXE9 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
BC048679D3YXE9 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
BC048679D3YXE9 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
BC048679D3YXE9 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
BC048679D3YXE9 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
BC048679D3YXE9 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
BC048679D3YXE9 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
BC048679D3YXE9 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
BC048679D3YXE9 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
BC048679D3YXE9 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
BC048679D3YXE9 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
BC048679D3YXE9 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
BC048679D3YXE9 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
BC048679D3YXE9 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms