Protein–RNA interactions for Protein: D3YWC7

Fam47e, Family with sequence similarity 47, member E, mousemouse

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam47eD3YWC7 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Fam47eD3YWC7 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Fam47eD3YWC7 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Fam47eD3YWC7 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Fam47eD3YWC7 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Fam47eD3YWC7 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Fam47eD3YWC7 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Fam47eD3YWC7 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Fam47eD3YWC7 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Fam47eD3YWC7 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Fam47eD3YWC7 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Fam47eD3YWC7 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Fam47eD3YWC7 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Fam47eD3YWC7 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24■■□□□ 1.43
Fam47eD3YWC7 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Fam47eD3YWC7 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Fam47eD3YWC7 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Fam47eD3YWC7 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Fam47eD3YWC7 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Fam47eD3YWC7 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Fam47eD3YWC7 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Fam47eD3YWC7 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Fam47eD3YWC7 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Fam47eD3YWC7 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Fam47eD3YWC7 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Fam47eD3YWC7 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Fam47eD3YWC7 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Fam47eD3YWC7 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Fam47eD3YWC7 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Fam47eD3YWC7 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Fam47eD3YWC7 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Fam47eD3YWC7 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Fam47eD3YWC7 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Fam47eD3YWC7 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Fam47eD3YWC7 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Fam47eD3YWC7 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Fam47eD3YWC7 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Fam47eD3YWC7 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Fam47eD3YWC7 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Fam47eD3YWC7 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Fam47eD3YWC7 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Fam47eD3YWC7 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Fam47eD3YWC7 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Fam47eD3YWC7 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Fam47eD3YWC7 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Fam47eD3YWC7 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Fam47eD3YWC7 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Fam47eD3YWC7 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Fam47eD3YWC7 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Fam47eD3YWC7 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Fam47eD3YWC7 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Fam47eD3YWC7 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Fam47eD3YWC7 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Fam47eD3YWC7 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Fam47eD3YWC7 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Fam47eD3YWC7 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Fam47eD3YWC7 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Fam47eD3YWC7 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Fam47eD3YWC7 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Fam47eD3YWC7 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Fam47eD3YWC7 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Fam47eD3YWC7 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Fam47eD3YWC7 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Fam47eD3YWC7 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Fam47eD3YWC7 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Fam47eD3YWC7 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Fam47eD3YWC7 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Fam47eD3YWC7 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Fam47eD3YWC7 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Fam47eD3YWC7 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Fam47eD3YWC7 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Fam47eD3YWC7 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Fam47eD3YWC7 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Fam47eD3YWC7 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Fam47eD3YWC7 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Fam47eD3YWC7 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Fam47eD3YWC7 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Fam47eD3YWC7 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Fam47eD3YWC7 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Fam47eD3YWC7 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Fam47eD3YWC7 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Fam47eD3YWC7 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Fam47eD3YWC7 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Fam47eD3YWC7 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Fam47eD3YWC7 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Fam47eD3YWC7 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Fam47eD3YWC7 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Fam47eD3YWC7 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Fam47eD3YWC7 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Fam47eD3YWC7 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Fam47eD3YWC7 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Fam47eD3YWC7 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Fam47eD3YWC7 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Fam47eD3YWC7 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Fam47eD3YWC7 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Fam47eD3YWC7 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Fam47eD3YWC7 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Fam47eD3YWC7 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Fam47eD3YWC7 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Fam47eD3YWC7 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.8 ms