Protein–RNA interactions for Protein: D3YUR1

4930444P10Rik, RIKEN cDNA 4930444P10 gene, mousemouse

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930444P10RikD3YUR1 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
4930444P10RikD3YUR1 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
4930444P10RikD3YUR1 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
4930444P10RikD3YUR1 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
4930444P10RikD3YUR1 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
4930444P10RikD3YUR1 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
4930444P10RikD3YUR1 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
4930444P10RikD3YUR1 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
4930444P10RikD3YUR1 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
4930444P10RikD3YUR1 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
4930444P10RikD3YUR1 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
4930444P10RikD3YUR1 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
4930444P10RikD3YUR1 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
4930444P10RikD3YUR1 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
4930444P10RikD3YUR1 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
4930444P10RikD3YUR1 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
4930444P10RikD3YUR1 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
4930444P10RikD3YUR1 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
4930444P10RikD3YUR1 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
4930444P10RikD3YUR1 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
4930444P10RikD3YUR1 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
4930444P10RikD3YUR1 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
4930444P10RikD3YUR1 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
4930444P10RikD3YUR1 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
4930444P10RikD3YUR1 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
4930444P10RikD3YUR1 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
4930444P10RikD3YUR1 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
4930444P10RikD3YUR1 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
4930444P10RikD3YUR1 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
4930444P10RikD3YUR1 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
4930444P10RikD3YUR1 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
4930444P10RikD3YUR1 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
4930444P10RikD3YUR1 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
4930444P10RikD3YUR1 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
4930444P10RikD3YUR1 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
4930444P10RikD3YUR1 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
4930444P10RikD3YUR1 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
4930444P10RikD3YUR1 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
4930444P10RikD3YUR1 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
4930444P10RikD3YUR1 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
4930444P10RikD3YUR1 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
4930444P10RikD3YUR1 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
4930444P10RikD3YUR1 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
4930444P10RikD3YUR1 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
4930444P10RikD3YUR1 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
4930444P10RikD3YUR1 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
4930444P10RikD3YUR1 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
4930444P10RikD3YUR1 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
4930444P10RikD3YUR1 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
4930444P10RikD3YUR1 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
4930444P10RikD3YUR1 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
4930444P10RikD3YUR1 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
4930444P10RikD3YUR1 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
4930444P10RikD3YUR1 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
4930444P10RikD3YUR1 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
4930444P10RikD3YUR1 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
4930444P10RikD3YUR1 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
4930444P10RikD3YUR1 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
4930444P10RikD3YUR1 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC19.4■□□□□ 0.7
4930444P10RikD3YUR1 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.7
4930444P10RikD3YUR1 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
4930444P10RikD3YUR1 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
4930444P10RikD3YUR1 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
4930444P10RikD3YUR1 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
4930444P10RikD3YUR1 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
4930444P10RikD3YUR1 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
4930444P10RikD3YUR1 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
4930444P10RikD3YUR1 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
4930444P10RikD3YUR1 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
4930444P10RikD3YUR1 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
4930444P10RikD3YUR1 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
4930444P10RikD3YUR1 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
4930444P10RikD3YUR1 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
4930444P10RikD3YUR1 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
4930444P10RikD3YUR1 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
4930444P10RikD3YUR1 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
4930444P10RikD3YUR1 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
4930444P10RikD3YUR1 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
4930444P10RikD3YUR1 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
4930444P10RikD3YUR1 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
4930444P10RikD3YUR1 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
4930444P10RikD3YUR1 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
4930444P10RikD3YUR1 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
4930444P10RikD3YUR1 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
4930444P10RikD3YUR1 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
4930444P10RikD3YUR1 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
4930444P10RikD3YUR1 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
4930444P10RikD3YUR1 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
4930444P10RikD3YUR1 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
4930444P10RikD3YUR1 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
4930444P10RikD3YUR1 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
4930444P10RikD3YUR1 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
4930444P10RikD3YUR1 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
4930444P10RikD3YUR1 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
4930444P10RikD3YUR1 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
4930444P10RikD3YUR1 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
4930444P10RikD3YUR1 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
4930444P10RikD3YUR1 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
4930444P10RikD3YUR1 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
4930444P10RikD3YUR1 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms