Protein–RNA interactions for Protein: C6KI89

Catsperg2, Cation channel sperm-associated protein subunit gamma 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Catsperg2C6KI89 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Catsperg2C6KI89 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Catsperg2C6KI89 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Catsperg2C6KI89 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Catsperg2C6KI89 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Catsperg2C6KI89 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Catsperg2C6KI89 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Catsperg2C6KI89 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Catsperg2C6KI89 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Catsperg2C6KI89 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Catsperg2C6KI89 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Catsperg2C6KI89 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Catsperg2C6KI89 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Catsperg2C6KI89 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Catsperg2C6KI89 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Catsperg2C6KI89 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Catsperg2C6KI89 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Catsperg2C6KI89 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Catsperg2C6KI89 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Catsperg2C6KI89 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Catsperg2C6KI89 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Catsperg2C6KI89 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Catsperg2C6KI89 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Catsperg2C6KI89 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Catsperg2C6KI89 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Catsperg2C6KI89 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Catsperg2C6KI89 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Catsperg2C6KI89 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Catsperg2C6KI89 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Catsperg2C6KI89 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Catsperg2C6KI89 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Catsperg2C6KI89 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Catsperg2C6KI89 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Catsperg2C6KI89 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Catsperg2C6KI89 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Catsperg2C6KI89 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Catsperg2C6KI89 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Catsperg2C6KI89 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Catsperg2C6KI89 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Catsperg2C6KI89 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Catsperg2C6KI89 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Catsperg2C6KI89 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Catsperg2C6KI89 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Catsperg2C6KI89 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Catsperg2C6KI89 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Catsperg2C6KI89 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Catsperg2C6KI89 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Catsperg2C6KI89 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Catsperg2C6KI89 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Catsperg2C6KI89 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Catsperg2C6KI89 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Catsperg2C6KI89 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Catsperg2C6KI89 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Catsperg2C6KI89 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Catsperg2C6KI89 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Catsperg2C6KI89 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Catsperg2C6KI89 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Catsperg2C6KI89 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Catsperg2C6KI89 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Catsperg2C6KI89 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Catsperg2C6KI89 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Catsperg2C6KI89 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Catsperg2C6KI89 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Catsperg2C6KI89 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Catsperg2C6KI89 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Catsperg2C6KI89 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Catsperg2C6KI89 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Catsperg2C6KI89 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Catsperg2C6KI89 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Catsperg2C6KI89 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Catsperg2C6KI89 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Catsperg2C6KI89 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Catsperg2C6KI89 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Catsperg2C6KI89 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Catsperg2C6KI89 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Catsperg2C6KI89 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Catsperg2C6KI89 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Catsperg2C6KI89 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Catsperg2C6KI89 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Catsperg2C6KI89 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Catsperg2C6KI89 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Catsperg2C6KI89 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Catsperg2C6KI89 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Catsperg2C6KI89 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Catsperg2C6KI89 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Catsperg2C6KI89 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Catsperg2C6KI89 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Catsperg2C6KI89 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Catsperg2C6KI89 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Catsperg2C6KI89 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Catsperg2C6KI89 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Catsperg2C6KI89 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Catsperg2C6KI89 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Catsperg2C6KI89 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Catsperg2C6KI89 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Catsperg2C6KI89 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Catsperg2C6KI89 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Catsperg2C6KI89 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Catsperg2C6KI89 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Catsperg2C6KI89 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.5 ms