Protein–RNA interactions for Protein: B9EJQ9

Rhox3g, Reproductive homeobox 3G, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhox3gB9EJQ9 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Rhox3gB9EJQ9 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Rhox3gB9EJQ9 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Rhox3gB9EJQ9 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Rhox3gB9EJQ9 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Rhox3gB9EJQ9 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Rhox3gB9EJQ9 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Rhox3gB9EJQ9 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Rhox3gB9EJQ9 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Rhox3gB9EJQ9 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Rhox3gB9EJQ9 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Rhox3gB9EJQ9 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Rhox3gB9EJQ9 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Rhox3gB9EJQ9 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Rhox3gB9EJQ9 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Rhox3gB9EJQ9 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Rhox3gB9EJQ9 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Rhox3gB9EJQ9 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Rhox3gB9EJQ9 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Rhox3gB9EJQ9 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Rhox3gB9EJQ9 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Rhox3gB9EJQ9 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Rhox3gB9EJQ9 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Rhox3gB9EJQ9 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Rhox3gB9EJQ9 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Rhox3gB9EJQ9 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Rhox3gB9EJQ9 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Rhox3gB9EJQ9 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Rhox3gB9EJQ9 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
Rhox3gB9EJQ9 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Rhox3gB9EJQ9 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Rhox3gB9EJQ9 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Rhox3gB9EJQ9 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Rhox3gB9EJQ9 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Rhox3gB9EJQ9 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Rhox3gB9EJQ9 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Rhox3gB9EJQ9 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Rhox3gB9EJQ9 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Rhox3gB9EJQ9 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Rhox3gB9EJQ9 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Rhox3gB9EJQ9 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Rhox3gB9EJQ9 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Rhox3gB9EJQ9 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Rhox3gB9EJQ9 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Rhox3gB9EJQ9 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Rhox3gB9EJQ9 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Rhox3gB9EJQ9 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rhox3gB9EJQ9 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rhox3gB9EJQ9 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rhox3gB9EJQ9 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rhox3gB9EJQ9 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rhox3gB9EJQ9 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rhox3gB9EJQ9 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rhox3gB9EJQ9 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rhox3gB9EJQ9 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rhox3gB9EJQ9 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rhox3gB9EJQ9 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Rhox3gB9EJQ9 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rhox3gB9EJQ9 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rhox3gB9EJQ9 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rhox3gB9EJQ9 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rhox3gB9EJQ9 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rhox3gB9EJQ9 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rhox3gB9EJQ9 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rhox3gB9EJQ9 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rhox3gB9EJQ9 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rhox3gB9EJQ9 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rhox3gB9EJQ9 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rhox3gB9EJQ9 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rhox3gB9EJQ9 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rhox3gB9EJQ9 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rhox3gB9EJQ9 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Rhox3gB9EJQ9 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rhox3gB9EJQ9 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rhox3gB9EJQ9 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rhox3gB9EJQ9 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rhox3gB9EJQ9 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rhox3gB9EJQ9 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rhox3gB9EJQ9 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rhox3gB9EJQ9 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rhox3gB9EJQ9 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rhox3gB9EJQ9 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rhox3gB9EJQ9 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rhox3gB9EJQ9 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Rhox3gB9EJQ9 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Rhox3gB9EJQ9 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rhox3gB9EJQ9 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
Rhox3gB9EJQ9 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rhox3gB9EJQ9 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rhox3gB9EJQ9 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rhox3gB9EJQ9 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rhox3gB9EJQ9 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rhox3gB9EJQ9 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rhox3gB9EJQ9 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rhox3gB9EJQ9 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rhox3gB9EJQ9 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rhox3gB9EJQ9 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rhox3gB9EJQ9 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rhox3gB9EJQ9 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rhox3gB9EJQ9 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms