Protein–RNA interactions for Protein: B8QI36

Ppfia4, Liprin-alpha 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,187 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfia4B8QI36 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1,91
Ppfia4B8QI36 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1,91
Ppfia4B8QI36 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,98■■□□□ 1,91
Ppfia4B8QI36 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26,98■■□□□ 1,91
Ppfia4B8QI36 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,97■■□□□ 1,91
Ppfia4B8QI36 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC26,97■■□□□ 1,91
Ppfia4B8QI36 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC26,96■■□□□ 1,91
Ppfia4B8QI36 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26,96■■□□□ 1,91
Ppfia4B8QI36 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,95■■□□□ 1,91
Ppfia4B8QI36 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,94■■□□□ 1,9
Ppfia4B8QI36 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,94■■□□□ 1,9
Ppfia4B8QI36 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26,93■■□□□ 1,9
Ppfia4B8QI36 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,93■■□□□ 1,9
Ppfia4B8QI36 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,93■■□□□ 1,9
Ppfia4B8QI36 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC26,92■■□□□ 1,9
Ppfia4B8QI36 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,92■■□□□ 1,9
Ppfia4B8QI36 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26,92■■□□□ 1,9
Ppfia4B8QI36 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC26,89■■□□□ 1,9
Ppfia4B8QI36 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC26,89■■□□□ 1,9
Ppfia4B8QI36 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC26,89■■□□□ 1,9
Ppfia4B8QI36 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC26,89■■□□□ 1,89
Ppfia4B8QI36 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,88■■□□□ 1,89
Ppfia4B8QI36 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,87■■□□□ 1,89
Ppfia4B8QI36 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,87■■□□□ 1,89
Ppfia4B8QI36 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,87■■□□□ 1,89
Ppfia4B8QI36 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,87■■□□□ 1,89
Ppfia4B8QI36 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,85■■□□□ 1,89
Ppfia4B8QI36 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26,84■■□□□ 1,89
Ppfia4B8QI36 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26,83■■□□□ 1,89
Ppfia4B8QI36 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26,82■■□□□ 1,88
Ppfia4B8QI36 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26,82■■□□□ 1,88
Ppfia4B8QI36 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26,82■■□□□ 1,88
Ppfia4B8QI36 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,81■■□□□ 1,88
Ppfia4B8QI36 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC26,8■■□□□ 1,88
Ppfia4B8QI36 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC26,79■■□□□ 1,88
Ppfia4B8QI36 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,79■■□□□ 1,88
Ppfia4B8QI36 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26,76■■□□□ 1,87
Ppfia4B8QI36 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,76■■□□□ 1,87
Ppfia4B8QI36 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC26,75■■□□□ 1,87
Ppfia4B8QI36 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,75■■□□□ 1,87
Ppfia4B8QI36 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,74■■□□□ 1,87
Ppfia4B8QI36 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,74■■□□□ 1,87
Ppfia4B8QI36 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC26,74■■□□□ 1,87
Ppfia4B8QI36 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC26,74■■□□□ 1,87
Ppfia4B8QI36 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26,74■■□□□ 1,87
Ppfia4B8QI36 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,74■■□□□ 1,87
Ppfia4B8QI36 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC26,74■■□□□ 1,87
Ppfia4B8QI36 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC26,73■■□□□ 1,87
Ppfia4B8QI36 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26,72■■□□□ 1,87
Ppfia4B8QI36 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC26,72■■□□□ 1,87
Ppfia4B8QI36 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26,72■■□□□ 1,87
Ppfia4B8QI36 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC26,71■■□□□ 1,87
Ppfia4B8QI36 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,71■■□□□ 1,87
Ppfia4B8QI36 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,71■■□□□ 1,87
Ppfia4B8QI36 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,71■■□□□ 1,87
Ppfia4B8QI36 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26,7■■□□□ 1,86
Ppfia4B8QI36 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,69■■□□□ 1,86
Ppfia4B8QI36 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC26,68■■□□□ 1,86
Ppfia4B8QI36 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,67■■□□□ 1,86
Ppfia4B8QI36 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,67■■□□□ 1,86
Ppfia4B8QI36 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,66■■□□□ 1,86
Ppfia4B8QI36 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC26,66■■□□□ 1,86
Ppfia4B8QI36 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26,66■■□□□ 1,86
Ppfia4B8QI36 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC26,66■■□□□ 1,86
Ppfia4B8QI36 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26,65■■□□□ 1,86
Ppfia4B8QI36 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,65■■□□□ 1,86
Ppfia4B8QI36 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC26,65■■□□□ 1,86
Ppfia4B8QI36 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26,65■■□□□ 1,86
Ppfia4B8QI36 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC26,65■■□□□ 1,86
Ppfia4B8QI36 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC26,64■■□□□ 1,86
Ppfia4B8QI36 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC26,64■■□□□ 1,86
Ppfia4B8QI36 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,63■■□□□ 1,85
Ppfia4B8QI36 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,63■■□□□ 1,85
Ppfia4B8QI36 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26,62■■□□□ 1,85
Ppfia4B8QI36 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC26,62■■□□□ 1,85
Ppfia4B8QI36 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,62■■□□□ 1,85
Ppfia4B8QI36 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,62■■□□□ 1,85
Ppfia4B8QI36 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26,62■■□□□ 1,85
Ppfia4B8QI36 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,6■■□□□ 1,85
Ppfia4B8QI36 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26,6■■□□□ 1,85
Ppfia4B8QI36 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC26,6■■□□□ 1,85
Ppfia4B8QI36 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC26,6■■□□□ 1,85
Ppfia4B8QI36 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,6■■□□□ 1,85
Ppfia4B8QI36 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,6■■□□□ 1,85
Ppfia4B8QI36 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26,59■■□□□ 1,85
Ppfia4B8QI36 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC26,59■■□□□ 1,85
Ppfia4B8QI36 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,59■■□□□ 1,85
Ppfia4B8QI36 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,58■■□□□ 1,85
Ppfia4B8QI36 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,57■■□□□ 1,84
Ppfia4B8QI36 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC26,57■■□□□ 1,84
Ppfia4B8QI36 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,57■■□□□ 1,84
Ppfia4B8QI36 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26,56■■□□□ 1,84
Ppfia4B8QI36 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC26,56■■□□□ 1,84
Ppfia4B8QI36 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,56■■□□□ 1,84
Ppfia4B8QI36 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC26,55■■□□□ 1,84
Ppfia4B8QI36 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC26,55■■□□□ 1,84
Ppfia4B8QI36 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,54■■□□□ 1,84
Ppfia4B8QI36 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26,53■■□□□ 1,84
Ppfia4B8QI36 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,53■■□□□ 1,84
Ppfia4B8QI36 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC26,51■■□□□ 1,83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32,8 ms