Protein–RNA interactions for Protein: B2RUQ2

Usf3, Gene model 608, (NCBI), mousemouse

Predictions only

Length 2,221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usf3B2RUQ2 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Usf3B2RUQ2 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Usf3B2RUQ2 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Usf3B2RUQ2 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Usf3B2RUQ2 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Usf3B2RUQ2 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Usf3B2RUQ2 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Usf3B2RUQ2 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Usf3B2RUQ2 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Usf3B2RUQ2 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Usf3B2RUQ2 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Usf3B2RUQ2 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Usf3B2RUQ2 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Usf3B2RUQ2 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Usf3B2RUQ2 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Usf3B2RUQ2 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Usf3B2RUQ2 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Usf3B2RUQ2 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Usf3B2RUQ2 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Usf3B2RUQ2 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Usf3B2RUQ2 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Usf3B2RUQ2 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Usf3B2RUQ2 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Usf3B2RUQ2 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Usf3B2RUQ2 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Usf3B2RUQ2 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Usf3B2RUQ2 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Usf3B2RUQ2 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Usf3B2RUQ2 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Usf3B2RUQ2 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Usf3B2RUQ2 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Usf3B2RUQ2 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Usf3B2RUQ2 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Usf3B2RUQ2 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Usf3B2RUQ2 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Usf3B2RUQ2 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Usf3B2RUQ2 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Usf3B2RUQ2 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Usf3B2RUQ2 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Usf3B2RUQ2 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Usf3B2RUQ2 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Usf3B2RUQ2 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Usf3B2RUQ2 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Usf3B2RUQ2 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Usf3B2RUQ2 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Usf3B2RUQ2 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Usf3B2RUQ2 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Usf3B2RUQ2 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Usf3B2RUQ2 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Usf3B2RUQ2 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Usf3B2RUQ2 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Usf3B2RUQ2 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Usf3B2RUQ2 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Usf3B2RUQ2 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Usf3B2RUQ2 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Usf3B2RUQ2 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Usf3B2RUQ2 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Usf3B2RUQ2 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Usf3B2RUQ2 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Usf3B2RUQ2 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Usf3B2RUQ2 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Usf3B2RUQ2 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Usf3B2RUQ2 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Usf3B2RUQ2 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Usf3B2RUQ2 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Usf3B2RUQ2 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Usf3B2RUQ2 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Usf3B2RUQ2 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Usf3B2RUQ2 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Usf3B2RUQ2 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Usf3B2RUQ2 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Usf3B2RUQ2 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Usf3B2RUQ2 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Usf3B2RUQ2 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Usf3B2RUQ2 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Usf3B2RUQ2 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Usf3B2RUQ2 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Usf3B2RUQ2 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Usf3B2RUQ2 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Usf3B2RUQ2 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Usf3B2RUQ2 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Usf3B2RUQ2 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Usf3B2RUQ2 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Usf3B2RUQ2 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Usf3B2RUQ2 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Usf3B2RUQ2 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Usf3B2RUQ2 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Usf3B2RUQ2 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Usf3B2RUQ2 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Usf3B2RUQ2 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Usf3B2RUQ2 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Usf3B2RUQ2 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Usf3B2RUQ2 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Usf3B2RUQ2 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Usf3B2RUQ2 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Usf3B2RUQ2 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Usf3B2RUQ2 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Usf3B2RUQ2 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Usf3B2RUQ2 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Usf3B2RUQ2 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 334.6 ms