Protein–RNA interactions for Protein: B2RU40

Prrt4, Proline-rich transmembrane protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 902 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt4B2RU40 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Prrt4B2RU40 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Prrt4B2RU40 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Prrt4B2RU40 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Prrt4B2RU40 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Prrt4B2RU40 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Prrt4B2RU40 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Prrt4B2RU40 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Prrt4B2RU40 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Prrt4B2RU40 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Prrt4B2RU40 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Prrt4B2RU40 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Prrt4B2RU40 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Prrt4B2RU40 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Prrt4B2RU40 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Prrt4B2RU40 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Prrt4B2RU40 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Prrt4B2RU40 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Prrt4B2RU40 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Prrt4B2RU40 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Prrt4B2RU40 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Prrt4B2RU40 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Prrt4B2RU40 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Prrt4B2RU40 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Prrt4B2RU40 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Prrt4B2RU40 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Prrt4B2RU40 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Prrt4B2RU40 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Prrt4B2RU40 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Prrt4B2RU40 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Prrt4B2RU40 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Prrt4B2RU40 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Prrt4B2RU40 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Prrt4B2RU40 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Prrt4B2RU40 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Prrt4B2RU40 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Prrt4B2RU40 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Prrt4B2RU40 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Prrt4B2RU40 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Prrt4B2RU40 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Prrt4B2RU40 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Prrt4B2RU40 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Prrt4B2RU40 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Prrt4B2RU40 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Prrt4B2RU40 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Prrt4B2RU40 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Prrt4B2RU40 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Prrt4B2RU40 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Prrt4B2RU40 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Prrt4B2RU40 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Prrt4B2RU40 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Prrt4B2RU40 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Prrt4B2RU40 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Prrt4B2RU40 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Prrt4B2RU40 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Prrt4B2RU40 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Prrt4B2RU40 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Prrt4B2RU40 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Prrt4B2RU40 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Prrt4B2RU40 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Prrt4B2RU40 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Prrt4B2RU40 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Prrt4B2RU40 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Prrt4B2RU40 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Prrt4B2RU40 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Prrt4B2RU40 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Prrt4B2RU40 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Prrt4B2RU40 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Prrt4B2RU40 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Prrt4B2RU40 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Prrt4B2RU40 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Prrt4B2RU40 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Prrt4B2RU40 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Prrt4B2RU40 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Prrt4B2RU40 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Prrt4B2RU40 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Prrt4B2RU40 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Prrt4B2RU40 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Prrt4B2RU40 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Prrt4B2RU40 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Prrt4B2RU40 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Prrt4B2RU40 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Prrt4B2RU40 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Prrt4B2RU40 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Prrt4B2RU40 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Prrt4B2RU40 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Prrt4B2RU40 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Prrt4B2RU40 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Prrt4B2RU40 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Prrt4B2RU40 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Prrt4B2RU40 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Prrt4B2RU40 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Prrt4B2RU40 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Prrt4B2RU40 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Prrt4B2RU40 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Prrt4B2RU40 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Prrt4B2RU40 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Prrt4B2RU40 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Prrt4B2RU40 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Prrt4B2RU40 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms