Protein–RNA interactions for Protein: B0V2N1

Ptprs, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase S, mousemouse

Predictions only

Length 1,907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprsB0V2N1 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PtprsB0V2N1 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PtprsB0V2N1 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PtprsB0V2N1 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PtprsB0V2N1 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PtprsB0V2N1 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PtprsB0V2N1 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
PtprsB0V2N1 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PtprsB0V2N1 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PtprsB0V2N1 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PtprsB0V2N1 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PtprsB0V2N1 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PtprsB0V2N1 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PtprsB0V2N1 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PtprsB0V2N1 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PtprsB0V2N1 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PtprsB0V2N1 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PtprsB0V2N1 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PtprsB0V2N1 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PtprsB0V2N1 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PtprsB0V2N1 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PtprsB0V2N1 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PtprsB0V2N1 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PtprsB0V2N1 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PtprsB0V2N1 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PtprsB0V2N1 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PtprsB0V2N1 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PtprsB0V2N1 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PtprsB0V2N1 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PtprsB0V2N1 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
PtprsB0V2N1 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PtprsB0V2N1 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PtprsB0V2N1 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PtprsB0V2N1 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PtprsB0V2N1 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PtprsB0V2N1 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PtprsB0V2N1 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PtprsB0V2N1 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
PtprsB0V2N1 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PtprsB0V2N1 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PtprsB0V2N1 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PtprsB0V2N1 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PtprsB0V2N1 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PtprsB0V2N1 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PtprsB0V2N1 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PtprsB0V2N1 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
PtprsB0V2N1 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PtprsB0V2N1 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PtprsB0V2N1 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PtprsB0V2N1 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PtprsB0V2N1 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PtprsB0V2N1 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PtprsB0V2N1 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PtprsB0V2N1 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PtprsB0V2N1 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PtprsB0V2N1 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PtprsB0V2N1 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PtprsB0V2N1 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PtprsB0V2N1 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PtprsB0V2N1 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PtprsB0V2N1 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PtprsB0V2N1 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PtprsB0V2N1 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PtprsB0V2N1 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PtprsB0V2N1 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PtprsB0V2N1 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PtprsB0V2N1 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PtprsB0V2N1 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PtprsB0V2N1 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PtprsB0V2N1 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PtprsB0V2N1 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PtprsB0V2N1 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PtprsB0V2N1 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PtprsB0V2N1 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PtprsB0V2N1 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
PtprsB0V2N1 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PtprsB0V2N1 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PtprsB0V2N1 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PtprsB0V2N1 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PtprsB0V2N1 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PtprsB0V2N1 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
PtprsB0V2N1 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PtprsB0V2N1 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PtprsB0V2N1 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PtprsB0V2N1 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PtprsB0V2N1 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PtprsB0V2N1 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PtprsB0V2N1 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
PtprsB0V2N1 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PtprsB0V2N1 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PtprsB0V2N1 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PtprsB0V2N1 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PtprsB0V2N1 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PtprsB0V2N1 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PtprsB0V2N1 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PtprsB0V2N1 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PtprsB0V2N1 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PtprsB0V2N1 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PtprsB0V2N1 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PtprsB0V2N1 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.1 ms