Protein–RNA interactions for Protein: A9C473

A630010A05Rik, RIKEN cDNA A630010A05 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A630010A05RikA9C473 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
A630010A05RikA9C473 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
A630010A05RikA9C473 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
A630010A05RikA9C473 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
A630010A05RikA9C473 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
A630010A05RikA9C473 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
A630010A05RikA9C473 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
A630010A05RikA9C473 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
A630010A05RikA9C473 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
A630010A05RikA9C473 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
A630010A05RikA9C473 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
A630010A05RikA9C473 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
A630010A05RikA9C473 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
A630010A05RikA9C473 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
A630010A05RikA9C473 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
A630010A05RikA9C473 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
A630010A05RikA9C473 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
A630010A05RikA9C473 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
A630010A05RikA9C473 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
A630010A05RikA9C473 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
A630010A05RikA9C473 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
A630010A05RikA9C473 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
A630010A05RikA9C473 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
A630010A05RikA9C473 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
A630010A05RikA9C473 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
A630010A05RikA9C473 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
A630010A05RikA9C473 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
A630010A05RikA9C473 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
A630010A05RikA9C473 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
A630010A05RikA9C473 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
A630010A05RikA9C473 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
A630010A05RikA9C473 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
A630010A05RikA9C473 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
A630010A05RikA9C473 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
A630010A05RikA9C473 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
A630010A05RikA9C473 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
A630010A05RikA9C473 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
A630010A05RikA9C473 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
A630010A05RikA9C473 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
A630010A05RikA9C473 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
A630010A05RikA9C473 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
A630010A05RikA9C473 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
A630010A05RikA9C473 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
A630010A05RikA9C473 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
A630010A05RikA9C473 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
A630010A05RikA9C473 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
A630010A05RikA9C473 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
A630010A05RikA9C473 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
A630010A05RikA9C473 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
A630010A05RikA9C473 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
A630010A05RikA9C473 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
A630010A05RikA9C473 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
A630010A05RikA9C473 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
A630010A05RikA9C473 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
A630010A05RikA9C473 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
A630010A05RikA9C473 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
A630010A05RikA9C473 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
A630010A05RikA9C473 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
A630010A05RikA9C473 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
A630010A05RikA9C473 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
A630010A05RikA9C473 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
A630010A05RikA9C473 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
A630010A05RikA9C473 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
A630010A05RikA9C473 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
A630010A05RikA9C473 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
A630010A05RikA9C473 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
A630010A05RikA9C473 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
A630010A05RikA9C473 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
A630010A05RikA9C473 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
A630010A05RikA9C473 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
A630010A05RikA9C473 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
A630010A05RikA9C473 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
A630010A05RikA9C473 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
A630010A05RikA9C473 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
A630010A05RikA9C473 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
A630010A05RikA9C473 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
A630010A05RikA9C473 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
A630010A05RikA9C473 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
A630010A05RikA9C473 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
A630010A05RikA9C473 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
A630010A05RikA9C473 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
A630010A05RikA9C473 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
A630010A05RikA9C473 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
A630010A05RikA9C473 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
A630010A05RikA9C473 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
A630010A05RikA9C473 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
A630010A05RikA9C473 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
A630010A05RikA9C473 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
A630010A05RikA9C473 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
A630010A05RikA9C473 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
A630010A05RikA9C473 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
A630010A05RikA9C473 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
A630010A05RikA9C473 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
A630010A05RikA9C473 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
A630010A05RikA9C473 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
A630010A05RikA9C473 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
A630010A05RikA9C473 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
A630010A05RikA9C473 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
A630010A05RikA9C473 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
A630010A05RikA9C473 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms