Protein–RNA interactions for Protein: A6NAS4

Gm10406, Alpha7-takusan, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm10406A6NAS4 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gm10406A6NAS4 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gm10406A6NAS4 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gm10406A6NAS4 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gm10406A6NAS4 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gm10406A6NAS4 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gm10406A6NAS4 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gm10406A6NAS4 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Gm10406A6NAS4 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gm10406A6NAS4 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gm10406A6NAS4 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gm10406A6NAS4 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gm10406A6NAS4 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gm10406A6NAS4 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gm10406A6NAS4 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gm10406A6NAS4 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gm10406A6NAS4 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gm10406A6NAS4 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gm10406A6NAS4 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gm10406A6NAS4 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gm10406A6NAS4 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Gm10406A6NAS4 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gm10406A6NAS4 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Gm10406A6NAS4 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Gm10406A6NAS4 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Gm10406A6NAS4 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Gm10406A6NAS4 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gm10406A6NAS4 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Gm10406A6NAS4 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gm10406A6NAS4 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gm10406A6NAS4 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gm10406A6NAS4 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gm10406A6NAS4 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gm10406A6NAS4 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gm10406A6NAS4 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gm10406A6NAS4 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gm10406A6NAS4 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gm10406A6NAS4 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gm10406A6NAS4 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gm10406A6NAS4 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gm10406A6NAS4 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gm10406A6NAS4 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gm10406A6NAS4 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gm10406A6NAS4 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Gm10406A6NAS4 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gm10406A6NAS4 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gm10406A6NAS4 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gm10406A6NAS4 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gm10406A6NAS4 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gm10406A6NAS4 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gm10406A6NAS4 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gm10406A6NAS4 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gm10406A6NAS4 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gm10406A6NAS4 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gm10406A6NAS4 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gm10406A6NAS4 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gm10406A6NAS4 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gm10406A6NAS4 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gm10406A6NAS4 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gm10406A6NAS4 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gm10406A6NAS4 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gm10406A6NAS4 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gm10406A6NAS4 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gm10406A6NAS4 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gm10406A6NAS4 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gm10406A6NAS4 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gm10406A6NAS4 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gm10406A6NAS4 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gm10406A6NAS4 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gm10406A6NAS4 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gm10406A6NAS4 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gm10406A6NAS4 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gm10406A6NAS4 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Gm10406A6NAS4 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gm10406A6NAS4 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gm10406A6NAS4 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gm10406A6NAS4 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gm10406A6NAS4 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gm10406A6NAS4 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gm10406A6NAS4 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gm10406A6NAS4 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gm10406A6NAS4 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gm10406A6NAS4 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gm10406A6NAS4 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gm10406A6NAS4 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gm10406A6NAS4 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gm10406A6NAS4 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Gm10406A6NAS4 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gm10406A6NAS4 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gm10406A6NAS4 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gm10406A6NAS4 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gm10406A6NAS4 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gm10406A6NAS4 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gm10406A6NAS4 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gm10406A6NAS4 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gm10406A6NAS4 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gm10406A6NAS4 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gm10406A6NAS4 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gm10406A6NAS4 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gm10406A6NAS4 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms