Protein–RNA interactions for Protein: A2AMM0

Cavin4, Caveolae-associated protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 362 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cavin4A2AMM0 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.66■■■□□ 2.82
Cavin4A2AMM0 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC32.64■■■□□ 2.82
Cavin4A2AMM0 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
Cavin4A2AMM0 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC32.64■■■□□ 2.82
Cavin4A2AMM0 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.63■■■□□ 2.81
Cavin4A2AMM0 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
Cavin4A2AMM0 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
Cavin4A2AMM0 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC32.62■■■□□ 2.81
Cavin4A2AMM0 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.61■■■□□ 2.81
Cavin4A2AMM0 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
Cavin4A2AMM0 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
Cavin4A2AMM0 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
Cavin4A2AMM0 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
Cavin4A2AMM0 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
Cavin4A2AMM0 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
Cavin4A2AMM0 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
Cavin4A2AMM0 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
Cavin4A2AMM0 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.59■■■□□ 2.81
Cavin4A2AMM0 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC32.59■■■□□ 2.81
Cavin4A2AMM0 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
Cavin4A2AMM0 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC32.55■■■□□ 2.8
Cavin4A2AMM0 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.54■■■□□ 2.8
Cavin4A2AMM0 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
Cavin4A2AMM0 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC32.53■■■□□ 2.8
Cavin4A2AMM0 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC32.52■■■□□ 2.8
Cavin4A2AMM0 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
Cavin4A2AMM0 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.51■■■□□ 2.79
Cavin4A2AMM0 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC32.51■■■□□ 2.79
Cavin4A2AMM0 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC32.5■■■□□ 2.79
Cavin4A2AMM0 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
Cavin4A2AMM0 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
Cavin4A2AMM0 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
Cavin4A2AMM0 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
Cavin4A2AMM0 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
Cavin4A2AMM0 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
Cavin4A2AMM0 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC32.46■■■□□ 2.79
Cavin4A2AMM0 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
Cavin4A2AMM0 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
Cavin4A2AMM0 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
Cavin4A2AMM0 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
Cavin4A2AMM0 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
Cavin4A2AMM0 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
Cavin4A2AMM0 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
Cavin4A2AMM0 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
Cavin4A2AMM0 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
Cavin4A2AMM0 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
Cavin4A2AMM0 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
Cavin4A2AMM0 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
Cavin4A2AMM0 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.35■■■□□ 2.77
Cavin4A2AMM0 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.34■■■□□ 2.77
Cavin4A2AMM0 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC32.33■■■□□ 2.77
Cavin4A2AMM0 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
Cavin4A2AMM0 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC32.31■■■□□ 2.76
Cavin4A2AMM0 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
Cavin4A2AMM0 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
Cavin4A2AMM0 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC32.29■■■□□ 2.76
Cavin4A2AMM0 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
Cavin4A2AMM0 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
Cavin4A2AMM0 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
Cavin4A2AMM0 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
Cavin4A2AMM0 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC32.27■■■□□ 2.76
Cavin4A2AMM0 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
Cavin4A2AMM0 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
Cavin4A2AMM0 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC32.24■■■□□ 2.75
Cavin4A2AMM0 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
Cavin4A2AMM0 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
Cavin4A2AMM0 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Cavin4A2AMM0 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Cavin4A2AMM0 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC32.22■■■□□ 2.75
Cavin4A2AMM0 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
Cavin4A2AMM0 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC32.21■■■□□ 2.75
Cavin4A2AMM0 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.2■■■□□ 2.75
Cavin4A2AMM0 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC32.19■■■□□ 2.74
Cavin4A2AMM0 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC32.18■■■□□ 2.74
Cavin4A2AMM0 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC32.18■■■□□ 2.74
Cavin4A2AMM0 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC32.18■■■□□ 2.74
Cavin4A2AMM0 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
Cavin4A2AMM0 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
Cavin4A2AMM0 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
Cavin4A2AMM0 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC32.14■■■□□ 2.74
Cavin4A2AMM0 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Cavin4A2AMM0 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC32.1■■■□□ 2.73
Cavin4A2AMM0 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Cavin4A2AMM0 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
Cavin4A2AMM0 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
Cavin4A2AMM0 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
Cavin4A2AMM0 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
Cavin4A2AMM0 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.06■■■□□ 2.72
Cavin4A2AMM0 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC32.06■■■□□ 2.72
Cavin4A2AMM0 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
Cavin4A2AMM0 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
Cavin4A2AMM0 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
Cavin4A2AMM0 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
Cavin4A2AMM0 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC32.03■■■□□ 2.72
Cavin4A2AMM0 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
Cavin4A2AMM0 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
Cavin4A2AMM0 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
Cavin4A2AMM0 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC32■■■□□ 2.71
Cavin4A2AMM0 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
Cavin4A2AMM0 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms