Protein–RNA interactions for Protein: A2AM80

Fam43b, Family with sequence similarity 43, member B, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam43bA2AM80 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.67
Fam43bA2AM80 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Fam43bA2AM80 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Fam43bA2AM80 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Fam43bA2AM80 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Fam43bA2AM80 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Fam43bA2AM80 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Fam43bA2AM80 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Fam43bA2AM80 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Fam43bA2AM80 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Fam43bA2AM80 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Fam43bA2AM80 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Fam43bA2AM80 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Fam43bA2AM80 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Fam43bA2AM80 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Fam43bA2AM80 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Fam43bA2AM80 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Fam43bA2AM80 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Fam43bA2AM80 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Fam43bA2AM80 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Fam43bA2AM80 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Fam43bA2AM80 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Fam43bA2AM80 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Fam43bA2AM80 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Fam43bA2AM80 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Fam43bA2AM80 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Fam43bA2AM80 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Fam43bA2AM80 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Fam43bA2AM80 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Fam43bA2AM80 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Fam43bA2AM80 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Fam43bA2AM80 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Fam43bA2AM80 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Fam43bA2AM80 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Fam43bA2AM80 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Fam43bA2AM80 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Fam43bA2AM80 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Fam43bA2AM80 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Fam43bA2AM80 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Fam43bA2AM80 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Fam43bA2AM80 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Fam43bA2AM80 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Fam43bA2AM80 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Fam43bA2AM80 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Fam43bA2AM80 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Fam43bA2AM80 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Fam43bA2AM80 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Fam43bA2AM80 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Fam43bA2AM80 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Fam43bA2AM80 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Fam43bA2AM80 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Fam43bA2AM80 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Fam43bA2AM80 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Fam43bA2AM80 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Fam43bA2AM80 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Fam43bA2AM80 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Fam43bA2AM80 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Fam43bA2AM80 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Fam43bA2AM80 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Fam43bA2AM80 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Fam43bA2AM80 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Fam43bA2AM80 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Fam43bA2AM80 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Fam43bA2AM80 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Fam43bA2AM80 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Fam43bA2AM80 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Fam43bA2AM80 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Fam43bA2AM80 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Fam43bA2AM80 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Fam43bA2AM80 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Fam43bA2AM80 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Fam43bA2AM80 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Fam43bA2AM80 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Fam43bA2AM80 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Fam43bA2AM80 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Fam43bA2AM80 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Fam43bA2AM80 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Fam43bA2AM80 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Fam43bA2AM80 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Fam43bA2AM80 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Fam43bA2AM80 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Fam43bA2AM80 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Fam43bA2AM80 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Fam43bA2AM80 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Fam43bA2AM80 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Fam43bA2AM80 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Fam43bA2AM80 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Fam43bA2AM80 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Fam43bA2AM80 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Fam43bA2AM80 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Fam43bA2AM80 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Fam43bA2AM80 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Fam43bA2AM80 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Fam43bA2AM80 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Fam43bA2AM80 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Fam43bA2AM80 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Fam43bA2AM80 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Fam43bA2AM80 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Fam43bA2AM80 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Fam43bA2AM80 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.2 ms