Protein–RNA interactions for Protein: A2AIX1

Sec16a, Protein transport protein sec16, mousemouse

Predictions only

Length 2,377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec16aA2AIX1 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sec16aA2AIX1 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sec16aA2AIX1 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sec16aA2AIX1 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sec16aA2AIX1 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sec16aA2AIX1 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sec16aA2AIX1 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sec16aA2AIX1 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sec16aA2AIX1 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sec16aA2AIX1 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Sec16aA2AIX1 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sec16aA2AIX1 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sec16aA2AIX1 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sec16aA2AIX1 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sec16aA2AIX1 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sec16aA2AIX1 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sec16aA2AIX1 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sec16aA2AIX1 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sec16aA2AIX1 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sec16aA2AIX1 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sec16aA2AIX1 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sec16aA2AIX1 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sec16aA2AIX1 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sec16aA2AIX1 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Sec16aA2AIX1 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Sec16aA2AIX1 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Sec16aA2AIX1 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sec16aA2AIX1 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sec16aA2AIX1 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sec16aA2AIX1 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sec16aA2AIX1 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sec16aA2AIX1 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sec16aA2AIX1 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sec16aA2AIX1 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sec16aA2AIX1 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sec16aA2AIX1 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sec16aA2AIX1 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sec16aA2AIX1 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Sec16aA2AIX1 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Sec16aA2AIX1 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Sec16aA2AIX1 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sec16aA2AIX1 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sec16aA2AIX1 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sec16aA2AIX1 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sec16aA2AIX1 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sec16aA2AIX1 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sec16aA2AIX1 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sec16aA2AIX1 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sec16aA2AIX1 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sec16aA2AIX1 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sec16aA2AIX1 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sec16aA2AIX1 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sec16aA2AIX1 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sec16aA2AIX1 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sec16aA2AIX1 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sec16aA2AIX1 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sec16aA2AIX1 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sec16aA2AIX1 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sec16aA2AIX1 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sec16aA2AIX1 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Sec16aA2AIX1 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sec16aA2AIX1 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Sec16aA2AIX1 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sec16aA2AIX1 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sec16aA2AIX1 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sec16aA2AIX1 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sec16aA2AIX1 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sec16aA2AIX1 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sec16aA2AIX1 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sec16aA2AIX1 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sec16aA2AIX1 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sec16aA2AIX1 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sec16aA2AIX1 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sec16aA2AIX1 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Sec16aA2AIX1 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sec16aA2AIX1 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sec16aA2AIX1 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sec16aA2AIX1 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sec16aA2AIX1 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Sec16aA2AIX1 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sec16aA2AIX1 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sec16aA2AIX1 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sec16aA2AIX1 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sec16aA2AIX1 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sec16aA2AIX1 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sec16aA2AIX1 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sec16aA2AIX1 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sec16aA2AIX1 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sec16aA2AIX1 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sec16aA2AIX1 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sec16aA2AIX1 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sec16aA2AIX1 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sec16aA2AIX1 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sec16aA2AIX1 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Sec16aA2AIX1 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Sec16aA2AIX1 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sec16aA2AIX1 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sec16aA2AIX1 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sec16aA2AIX1 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sec16aA2AIX1 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms