Protein–RNA interactions for Protein: A2A4F1

Rhox7a, Reproductive homeobox 7A, mousemouse

Predictions only

Length 281 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhox7aA2A4F1 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rhox7aA2A4F1 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rhox7aA2A4F1 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rhox7aA2A4F1 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rhox7aA2A4F1 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rhox7aA2A4F1 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rhox7aA2A4F1 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rhox7aA2A4F1 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Rhox7aA2A4F1 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rhox7aA2A4F1 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rhox7aA2A4F1 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rhox7aA2A4F1 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rhox7aA2A4F1 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rhox7aA2A4F1 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rhox7aA2A4F1 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rhox7aA2A4F1 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rhox7aA2A4F1 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rhox7aA2A4F1 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rhox7aA2A4F1 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rhox7aA2A4F1 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rhox7aA2A4F1 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rhox7aA2A4F1 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rhox7aA2A4F1 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rhox7aA2A4F1 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rhox7aA2A4F1 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rhox7aA2A4F1 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rhox7aA2A4F1 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Rhox7aA2A4F1 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rhox7aA2A4F1 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rhox7aA2A4F1 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rhox7aA2A4F1 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Rhox7aA2A4F1 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rhox7aA2A4F1 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rhox7aA2A4F1 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rhox7aA2A4F1 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rhox7aA2A4F1 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Rhox7aA2A4F1 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rhox7aA2A4F1 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rhox7aA2A4F1 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rhox7aA2A4F1 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Rhox7aA2A4F1 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Rhox7aA2A4F1 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rhox7aA2A4F1 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rhox7aA2A4F1 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rhox7aA2A4F1 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rhox7aA2A4F1 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rhox7aA2A4F1 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rhox7aA2A4F1 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rhox7aA2A4F1 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rhox7aA2A4F1 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rhox7aA2A4F1 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Rhox7aA2A4F1 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rhox7aA2A4F1 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rhox7aA2A4F1 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rhox7aA2A4F1 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rhox7aA2A4F1 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rhox7aA2A4F1 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rhox7aA2A4F1 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rhox7aA2A4F1 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rhox7aA2A4F1 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rhox7aA2A4F1 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rhox7aA2A4F1 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rhox7aA2A4F1 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rhox7aA2A4F1 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rhox7aA2A4F1 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rhox7aA2A4F1 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rhox7aA2A4F1 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rhox7aA2A4F1 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rhox7aA2A4F1 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rhox7aA2A4F1 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rhox7aA2A4F1 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rhox7aA2A4F1 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rhox7aA2A4F1 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rhox7aA2A4F1 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rhox7aA2A4F1 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rhox7aA2A4F1 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rhox7aA2A4F1 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rhox7aA2A4F1 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rhox7aA2A4F1 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rhox7aA2A4F1 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rhox7aA2A4F1 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rhox7aA2A4F1 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rhox7aA2A4F1 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rhox7aA2A4F1 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rhox7aA2A4F1 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rhox7aA2A4F1 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rhox7aA2A4F1 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rhox7aA2A4F1 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rhox7aA2A4F1 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rhox7aA2A4F1 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rhox7aA2A4F1 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rhox7aA2A4F1 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rhox7aA2A4F1 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rhox7aA2A4F1 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rhox7aA2A4F1 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rhox7aA2A4F1 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rhox7aA2A4F1 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rhox7aA2A4F1 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rhox7aA2A4F1 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rhox7aA2A4F1 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms