Protein–RNA interactions for Protein: A0A286YE38

4932443I19Rik, RIKEN cDNA 4932443I19 gene, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4932443I19RikA0A286YE38 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
4932443I19RikA0A286YE38 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
4932443I19RikA0A286YE38 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
4932443I19RikA0A286YE38 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
4932443I19RikA0A286YE38 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
4932443I19RikA0A286YE38 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
4932443I19RikA0A286YE38 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
4932443I19RikA0A286YE38 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
4932443I19RikA0A286YE38 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
4932443I19RikA0A286YE38 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
4932443I19RikA0A286YE38 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
4932443I19RikA0A286YE38 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
4932443I19RikA0A286YE38 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
4932443I19RikA0A286YE38 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
4932443I19RikA0A286YE38 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
4932443I19RikA0A286YE38 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
4932443I19RikA0A286YE38 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
4932443I19RikA0A286YE38 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
4932443I19RikA0A286YE38 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
4932443I19RikA0A286YE38 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
4932443I19RikA0A286YE38 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
4932443I19RikA0A286YE38 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
4932443I19RikA0A286YE38 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
4932443I19RikA0A286YE38 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
4932443I19RikA0A286YE38 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
4932443I19RikA0A286YE38 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
4932443I19RikA0A286YE38 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
4932443I19RikA0A286YE38 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
4932443I19RikA0A286YE38 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
4932443I19RikA0A286YE38 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
4932443I19RikA0A286YE38 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
4932443I19RikA0A286YE38 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
4932443I19RikA0A286YE38 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
4932443I19RikA0A286YE38 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
4932443I19RikA0A286YE38 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
4932443I19RikA0A286YE38 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
4932443I19RikA0A286YE38 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
4932443I19RikA0A286YE38 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
4932443I19RikA0A286YE38 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
4932443I19RikA0A286YE38 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
4932443I19RikA0A286YE38 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
4932443I19RikA0A286YE38 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
4932443I19RikA0A286YE38 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
4932443I19RikA0A286YE38 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
4932443I19RikA0A286YE38 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
4932443I19RikA0A286YE38 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
4932443I19RikA0A286YE38 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
4932443I19RikA0A286YE38 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
4932443I19RikA0A286YE38 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
4932443I19RikA0A286YE38 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
4932443I19RikA0A286YE38 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
4932443I19RikA0A286YE38 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
4932443I19RikA0A286YE38 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
4932443I19RikA0A286YE38 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
4932443I19RikA0A286YE38 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
4932443I19RikA0A286YE38 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
4932443I19RikA0A286YE38 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
4932443I19RikA0A286YE38 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
4932443I19RikA0A286YE38 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
4932443I19RikA0A286YE38 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
4932443I19RikA0A286YE38 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
4932443I19RikA0A286YE38 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
4932443I19RikA0A286YE38 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
4932443I19RikA0A286YE38 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
4932443I19RikA0A286YE38 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
4932443I19RikA0A286YE38 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
4932443I19RikA0A286YE38 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
4932443I19RikA0A286YE38 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
4932443I19RikA0A286YE38 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
4932443I19RikA0A286YE38 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
4932443I19RikA0A286YE38 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
4932443I19RikA0A286YE38 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
4932443I19RikA0A286YE38 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
4932443I19RikA0A286YE38 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
4932443I19RikA0A286YE38 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
4932443I19RikA0A286YE38 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
4932443I19RikA0A286YE38 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
4932443I19RikA0A286YE38 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
4932443I19RikA0A286YE38 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
4932443I19RikA0A286YE38 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
4932443I19RikA0A286YE38 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
4932443I19RikA0A286YE38 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
4932443I19RikA0A286YE38 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
4932443I19RikA0A286YE38 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
4932443I19RikA0A286YE38 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
4932443I19RikA0A286YE38 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
4932443I19RikA0A286YE38 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
4932443I19RikA0A286YE38 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
4932443I19RikA0A286YE38 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
4932443I19RikA0A286YE38 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
4932443I19RikA0A286YE38 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
4932443I19RikA0A286YE38 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
4932443I19RikA0A286YE38 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
4932443I19RikA0A286YE38 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
4932443I19RikA0A286YE38 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
4932443I19RikA0A286YE38 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
4932443I19RikA0A286YE38 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
4932443I19RikA0A286YE38 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
4932443I19RikA0A286YE38 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
4932443I19RikA0A286YE38 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.7 ms