Protein–RNA interactions for Protein: A0A1B0GS82

A730009L09Rik, RIKEN cDNA A730009L09 gene, mousemouse

Predictions only

Length 72 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A730009L09RikA0A1B0GS82 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
A730009L09RikA0A1B0GS82 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
A730009L09RikA0A1B0GS82 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
A730009L09RikA0A1B0GS82 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
A730009L09RikA0A1B0GS82 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
A730009L09RikA0A1B0GS82 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
A730009L09RikA0A1B0GS82 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
A730009L09RikA0A1B0GS82 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
A730009L09RikA0A1B0GS82 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
A730009L09RikA0A1B0GS82 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
A730009L09RikA0A1B0GS82 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
A730009L09RikA0A1B0GS82 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
A730009L09RikA0A1B0GS82 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
A730009L09RikA0A1B0GS82 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
A730009L09RikA0A1B0GS82 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
A730009L09RikA0A1B0GS82 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
A730009L09RikA0A1B0GS82 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
A730009L09RikA0A1B0GS82 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
A730009L09RikA0A1B0GS82 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
A730009L09RikA0A1B0GS82 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
A730009L09RikA0A1B0GS82 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
A730009L09RikA0A1B0GS82 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
A730009L09RikA0A1B0GS82 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
A730009L09RikA0A1B0GS82 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
A730009L09RikA0A1B0GS82 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
A730009L09RikA0A1B0GS82 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
A730009L09RikA0A1B0GS82 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
A730009L09RikA0A1B0GS82 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
A730009L09RikA0A1B0GS82 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
A730009L09RikA0A1B0GS82 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
A730009L09RikA0A1B0GS82 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
A730009L09RikA0A1B0GS82 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
A730009L09RikA0A1B0GS82 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
A730009L09RikA0A1B0GS82 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
A730009L09RikA0A1B0GS82 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
A730009L09RikA0A1B0GS82 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
A730009L09RikA0A1B0GS82 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
A730009L09RikA0A1B0GS82 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
A730009L09RikA0A1B0GS82 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
A730009L09RikA0A1B0GS82 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
A730009L09RikA0A1B0GS82 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
A730009L09RikA0A1B0GS82 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
A730009L09RikA0A1B0GS82 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
A730009L09RikA0A1B0GS82 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
A730009L09RikA0A1B0GS82 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
A730009L09RikA0A1B0GS82 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
A730009L09RikA0A1B0GS82 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
A730009L09RikA0A1B0GS82 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
A730009L09RikA0A1B0GS82 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
A730009L09RikA0A1B0GS82 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
A730009L09RikA0A1B0GS82 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
A730009L09RikA0A1B0GS82 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
A730009L09RikA0A1B0GS82 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
A730009L09RikA0A1B0GS82 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
A730009L09RikA0A1B0GS82 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
A730009L09RikA0A1B0GS82 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
A730009L09RikA0A1B0GS82 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
A730009L09RikA0A1B0GS82 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
A730009L09RikA0A1B0GS82 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
A730009L09RikA0A1B0GS82 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
A730009L09RikA0A1B0GS82 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
A730009L09RikA0A1B0GS82 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
A730009L09RikA0A1B0GS82 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
A730009L09RikA0A1B0GS82 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
A730009L09RikA0A1B0GS82 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
A730009L09RikA0A1B0GS82 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
A730009L09RikA0A1B0GS82 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
A730009L09RikA0A1B0GS82 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
A730009L09RikA0A1B0GS82 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
A730009L09RikA0A1B0GS82 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
A730009L09RikA0A1B0GS82 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
A730009L09RikA0A1B0GS82 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
A730009L09RikA0A1B0GS82 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
A730009L09RikA0A1B0GS82 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
A730009L09RikA0A1B0GS82 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
A730009L09RikA0A1B0GS82 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
A730009L09RikA0A1B0GS82 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
A730009L09RikA0A1B0GS82 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
A730009L09RikA0A1B0GS82 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
A730009L09RikA0A1B0GS82 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
A730009L09RikA0A1B0GS82 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
A730009L09RikA0A1B0GS82 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
A730009L09RikA0A1B0GS82 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
A730009L09RikA0A1B0GS82 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
A730009L09RikA0A1B0GS82 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
A730009L09RikA0A1B0GS82 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
A730009L09RikA0A1B0GS82 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
A730009L09RikA0A1B0GS82 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
A730009L09RikA0A1B0GS82 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
A730009L09RikA0A1B0GS82 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
A730009L09RikA0A1B0GS82 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
A730009L09RikA0A1B0GS82 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
A730009L09RikA0A1B0GS82 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
A730009L09RikA0A1B0GS82 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
A730009L09RikA0A1B0GS82 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
A730009L09RikA0A1B0GS82 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
A730009L09RikA0A1B0GS82 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
A730009L09RikA0A1B0GS82 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
A730009L09RikA0A1B0GS82 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
A730009L09RikA0A1B0GS82 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms