Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1K3

B230359F08Rik, RIKEN cDNA B230359F08 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
B230359F08RikA0A0B4J1K3 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
B230359F08RikA0A0B4J1K3 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
B230359F08RikA0A0B4J1K3 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
B230359F08RikA0A0B4J1K3 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
B230359F08RikA0A0B4J1K3 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
B230359F08RikA0A0B4J1K3 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms