Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1H5

Trbv20, T cell receptor beta, variable 20 (Fragment), mousemouse

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Length 111 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv20A0A0B4J1H5 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trbv20A0A0B4J1H5 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trbv20A0A0B4J1H5 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trbv20A0A0B4J1H5 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trbv20A0A0B4J1H5 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trbv20A0A0B4J1H5 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trbv20A0A0B4J1H5 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trbv20A0A0B4J1H5 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trbv20A0A0B4J1H5 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trbv20A0A0B4J1H5 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trbv20A0A0B4J1H5 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trbv20A0A0B4J1H5 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trbv20A0A0B4J1H5 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trbv20A0A0B4J1H5 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trbv20A0A0B4J1H5 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trbv20A0A0B4J1H5 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trbv20A0A0B4J1H5 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trbv20A0A0B4J1H5 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Trbv20A0A0B4J1H5 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Trbv20A0A0B4J1H5 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trbv20A0A0B4J1H5 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trbv20A0A0B4J1H5 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Trbv20A0A0B4J1H5 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trbv20A0A0B4J1H5 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trbv20A0A0B4J1H5 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trbv20A0A0B4J1H5 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trbv20A0A0B4J1H5 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trbv20A0A0B4J1H5 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trbv20A0A0B4J1H5 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trbv20A0A0B4J1H5 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trbv20A0A0B4J1H5 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trbv20A0A0B4J1H5 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trbv20A0A0B4J1H5 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trbv20A0A0B4J1H5 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trbv20A0A0B4J1H5 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trbv20A0A0B4J1H5 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trbv20A0A0B4J1H5 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trbv20A0A0B4J1H5 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trbv20A0A0B4J1H5 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Trbv20A0A0B4J1H5 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trbv20A0A0B4J1H5 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trbv20A0A0B4J1H5 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trbv20A0A0B4J1H5 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trbv20A0A0B4J1H5 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Trbv20A0A0B4J1H5 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trbv20A0A0B4J1H5 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trbv20A0A0B4J1H5 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trbv20A0A0B4J1H5 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trbv20A0A0B4J1H5 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trbv20A0A0B4J1H5 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trbv20A0A0B4J1H5 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trbv20A0A0B4J1H5 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trbv20A0A0B4J1H5 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trbv20A0A0B4J1H5 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trbv20A0A0B4J1H5 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trbv20A0A0B4J1H5 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Trbv20A0A0B4J1H5 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trbv20A0A0B4J1H5 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Trbv20A0A0B4J1H5 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Trbv20A0A0B4J1H5 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trbv20A0A0B4J1H5 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trbv20A0A0B4J1H5 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trbv20A0A0B4J1H5 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Trbv20A0A0B4J1H5 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Trbv20A0A0B4J1H5 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trbv20A0A0B4J1H5 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trbv20A0A0B4J1H5 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trbv20A0A0B4J1H5 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trbv20A0A0B4J1H5 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trbv20A0A0B4J1H5 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trbv20A0A0B4J1H5 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trbv20A0A0B4J1H5 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trbv20A0A0B4J1H5 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trbv20A0A0B4J1H5 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Trbv20A0A0B4J1H5 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Trbv20A0A0B4J1H5 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Trbv20A0A0B4J1H5 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Trbv20A0A0B4J1H5 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Trbv20A0A0B4J1H5 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trbv20A0A0B4J1H5 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trbv20A0A0B4J1H5 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Trbv20A0A0B4J1H5 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Trbv20A0A0B4J1H5 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trbv20A0A0B4J1H5 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trbv20A0A0B4J1H5 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trbv20A0A0B4J1H5 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trbv20A0A0B4J1H5 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Trbv20A0A0B4J1H5 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Trbv20A0A0B4J1H5 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Trbv20A0A0B4J1H5 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Trbv20A0A0B4J1H5 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Trbv20A0A0B4J1H5 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Trbv20A0A0B4J1H5 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Trbv20A0A0B4J1H5 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Trbv20A0A0B4J1H5 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Trbv20A0A0B4J1H5 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Trbv20A0A0B4J1H5 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Trbv20A0A0B4J1H5 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Trbv20A0A0B4J1H5 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Trbv20A0A0B4J1H5 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
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