Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1H1

Trbv12-2, T cell receptor beta, variable 12-2 (Fragment), mousemouse

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Length 124 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Trbv12-2A0A0B4J1H1 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Trbv12-2A0A0B4J1H1 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Trbv12-2A0A0B4J1H1 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Trbv12-2A0A0B4J1H1 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Trbv12-2A0A0B4J1H1 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Trbv12-2A0A0B4J1H1 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
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