Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,739 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 Gm32802-201ENSMUST00000219565 2409 ntAPPRIS P1 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Col5a3Q9JLI2 Gm9045-201ENSMUST00000219760 2409 ntAPPRIS P1 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Col5a3Q9JLI2 Nav2-216ENSMUST00000184945 10665 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Col5a3Q9JLI2 AC155710.1-201ENSMUST00000219913 1353 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Col5a3Q9JLI2 Cd36-204ENSMUST00000170051 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Col5a3Q9JLI2 Mapk9-204ENSMUST00000109178 1302 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Col5a3Q9JLI2 Gm8177-201ENSMUST00000181591 1336 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Col5a3Q9JLI2 Bdnf-208ENSMUST00000111049 3830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Col5a3Q9JLI2 Plscr2-202ENSMUST00000113044 1239 ntTSL 3 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Col5a3Q9JLI2 Gm11920-201ENSMUST00000118491 563 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Col5a3Q9JLI2 Gm12152-201ENSMUST00000122465 684 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Col5a3Q9JLI2 Platr2-201ENSMUST00000180834 521 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Col5a3Q9JLI2 1700011B04Rik-201ENSMUST00000189140 651 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Col5a3Q9JLI2 Gm30708-201ENSMUST00000202183 312 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Col5a3Q9JLI2 Gm45185-201ENSMUST00000207556 404 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Col5a3Q9JLI2 Gm5055-201ENSMUST00000215697 581 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Col5a3Q9JLI2 1700011B04Rik-207ENSMUST00000221256 800 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Col5a3Q9JLI2 1700011B04Rik-208ENSMUST00000221261 628 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Col5a3Q9JLI2 Gm2139-201ENSMUST00000222569 1075 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Col5a3Q9JLI2 1700011B04Rik-210ENSMUST00000222668 821 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Col5a3Q9JLI2 AL591207.2-201ENSMUST00000222991 337 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Col5a3Q9JLI2 AC138765.3-201ENSMUST00000227981 423 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Col5a3Q9JLI2 Cma2-202ENSMUST00000228263 857 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Col5a3Q9JLI2 Elmod2-206ENSMUST00000177594 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Col5a3Q9JLI2 Gm28635-201ENSMUST00000189772 4734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Col5a3Q9JLI2 Dsc3-203ENSMUST00000225110 3123 ntAPPRIS P2 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Col5a3Q9JLI2 Tgs1-201ENSMUST00000052712 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Col5a3Q9JLI2 Mcf2-202ENSMUST00000063507 4227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Col5a3Q9JLI2 Syt2-201ENSMUST00000121990 6879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Col5a3Q9JLI2 Tex11-201ENSMUST00000009814 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Col5a3Q9JLI2 Tjp1-201ENSMUST00000032729 6102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Col5a3Q9JLI2 Mcc-201ENSMUST00000089874 7858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Col5a3Q9JLI2 Scn3b-202ENSMUST00000114956 4045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Col5a3Q9JLI2 Gm29154-258ENSMUST00000217560 1733 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Col5a3Q9JLI2 AC154612.1-202ENSMUST00000224806 1725 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Col5a3Q9JLI2 Sh3bgrl2-201ENSMUST00000113215 4565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Col5a3Q9JLI2 Sbf2-205ENSMUST00000164759 7090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Col5a3Q9JLI2 Gm10439-201ENSMUST00000101181 1977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Col5a3Q9JLI2 Gm43970-201ENSMUST00000204346 3605 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Col5a3Q9JLI2 Add1-201ENSMUST00000001108 3898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Col5a3Q9JLI2 Tns1-208ENSMUST00000187584 9916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Col5a3Q9JLI2 Slc35b4-201ENSMUST00000019143 6253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Col5a3Q9JLI2 Gm28403-201ENSMUST00000188743 2710 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Col5a3Q9JLI2 Olfr1219-202ENSMUST00000213724 5669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Col5a3Q9JLI2 Gpr156-201ENSMUST00000061274 4581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Col5a3Q9JLI2 Cfb-206ENSMUST00000154526 2397 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Col5a3Q9JLI2 Trpm1-201ENSMUST00000085222 5711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Col5a3Q9JLI2 Pdgfrb-202ENSMUST00000115274 5423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
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Col5a3Q9JLI2 Zfp616-203ENSMUST00000116546 531 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
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Col5a3Q9JLI2 Peak1os-201ENSMUST00000181444 1264 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
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Col5a3Q9JLI2 Gm4556-201ENSMUST00000217808 355 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
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Col5a3Q9JLI2 Dlc1-206ENSMUST00000163663 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
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Col5a3Q9JLI2 Atg7-202ENSMUST00000169310 3895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
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Col5a3Q9JLI2 Rassf6-206ENSMUST00000202784 1919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Col5a3Q9JLI2 Ttc28-206ENSMUST00000156290 10688 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Col5a3Q9JLI2 Ablim1-203ENSMUST00000104902 5907 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Col5a3Q9JLI2 Pfkfb1-202ENSMUST00000112713 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Col5a3Q9JLI2 Inpp5d-201ENSMUST00000042275 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Col5a3Q9JLI2 Pld1-201ENSMUST00000067757 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Col5a3Q9JLI2 4930402F06Rik-202ENSMUST00000113010 1372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Col5a3Q9JLI2 Abcc3-206ENSMUST00000178136 5005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Col5a3Q9JLI2 Zic4-201ENSMUST00000066384 3891 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Col5a3Q9JLI2 C1qtnf7-201ENSMUST00000076939 3879 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Col5a3Q9JLI2 Gm43411-201ENSMUST00000196235 1579 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Col5a3Q9JLI2 Mme-201ENSMUST00000029400 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Col5a3Q9JLI2 Pcdhb3-201ENSMUST00000051754 3787 ntAPPRIS P1 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Col5a3Q9JLI2 Sorbs1-202ENSMUST00000099467 2817 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Col5a3Q9JLI2 Blm-202ENSMUST00000170315 4770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Col5a3Q9JLI2 Grik2-205ENSMUST00000218598 3245 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Col5a3Q9JLI2 Ighv12-3-201ENSMUST00000103485 353 ntAPPRIS P1 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Col5a3Q9JLI2 Trav19-201ENSMUST00000103674 446 ntAPPRIS P1 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Col5a3Q9JLI2 Clec4n-203ENSMUST00000117130 1136 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Col5a3Q9JLI2 Gm11902-201ENSMUST00000118849 270 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Col5a3Q9JLI2 4930405D11Rik-203ENSMUST00000142521 645 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Col5a3Q9JLI2 Gm16133-202ENSMUST00000160278 565 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Col5a3Q9JLI2 Gm5225-201ENSMUST00000178572 324 ntAPPRIS P1 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Col5a3Q9JLI2 Mir7235-201ENSMUST00000183796 56 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Col5a3Q9JLI2 Gm37502-201ENSMUST00000192981 356 ntTSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
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