Protein–RNA interactions for Protein: P23116

Eif3a, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eif3aP23116 Gm22915-201ENSMUST00000157615 136 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Eif3aP23116 Gm5039-201ENSMUST00000177747 435 ntAPPRIS P1 BASIC9□□□□□ -0.97
Eif3aP23116 Gm8332-201ENSMUST00000179468 435 ntAPPRIS P1 BASIC9□□□□□ -0.97
Eif3aP23116 Gm2035-201ENSMUST00000180053 435 ntAPPRIS P1 BASIC9□□□□□ -0.97
Eif3aP23116 Mir6769b-201ENSMUST00000184793 60 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Eif3aP23116 Gm29496-201ENSMUST00000189854 693 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Eif3aP23116 Gm43555-201ENSMUST00000196588 310 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Eif3aP23116 Gm43147-201ENSMUST00000196944 542 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Eif3aP23116 Gm43656-201ENSMUST00000197882 434 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Eif3aP23116 Gm31343-201ENSMUST00000207967 2454 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Eif3aP23116 Gm8275-201ENSMUST00000219732 424 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Eif3aP23116 Gm21936-201ENSMUST00000221442 435 ntAPPRIS P1 BASIC9□□□□□ -0.97
Eif3aP23116 AC133598.4-201ENSMUST00000224577 454 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Eif3aP23116 3300002A11Rik-201ENSMUST00000046994 654 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Eif3aP23116 Vmn1r76-201ENSMUST00000058772 975 ntAPPRIS P2 BASIC9□□□□□ -0.97
Eif3aP23116 Tcl1b2-201ENSMUST00000081379 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Eif3aP23116 n-R5s29-201ENSMUST00000082836 119 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Eif3aP23116 Gm24924-201ENSMUST00000084007 164 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Eif3aP23116 Olfr1044-201ENSMUST00000099906 945 ntAPPRIS P1 BASIC9□□□□□ -0.97
Eif3aP23116 Hmg20a-201ENSMUST00000034879 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Eif3aP23116 Cfap57-201ENSMUST00000071972 4020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Eif3aP23116 Anxa1-201ENSMUST00000025561 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Eif3aP23116 Serbp1-201ENSMUST00000042990 15474 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Eif3aP23116 Gm44769-201ENSMUST00000206120 2809 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
Eif3aP23116 Ccser1-201ENSMUST00000045522 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Eif3aP23116 Fam193a-201ENSMUST00000094867 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Eif3aP23116 Eif4e2-202ENSMUST00000076362 3394 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Eif3aP23116 Smg1-201ENSMUST00000032891 15557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Eif3aP23116 Ssbp1-202ENSMUST00000114779 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Eif3aP23116 Pfkfb3-214ENSMUST00000179584 4756 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Eif3aP23116 Pkib-202ENSMUST00000075992 5317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Eif3aP23116 Scn3a-201ENSMUST00000066432 9560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Eif3aP23116 Dph6-202ENSMUST00000055144 2476 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Eif3aP23116 AC091783.1-201ENSMUST00000223614 1613 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
Eif3aP23116 Gprasp2-201ENSMUST00000113136 3736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Eif3aP23116 4933411E06Rik-201ENSMUST00000186016 1493 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
Eif3aP23116 Gm28333-201ENSMUST00000186034 2168 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Eif3aP23116 Gm28718-201ENSMUST00000188417 2168 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Eif3aP23116 Gm28977-201ENSMUST00000188678 2168 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Eif3aP23116 Gm28315-201ENSMUST00000189948 2168 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Eif3aP23116 Gm29612-201ENSMUST00000191490 2168 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Eif3aP23116 Gm40778-201ENSMUST00000217825 1344 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
Eif3aP23116 Ablim1-201ENSMUST00000079360 7152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Eif3aP23116 Trappc8-201ENSMUST00000025177 5178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Eif3aP23116 Pdlim5-203ENSMUST00000090134 1722 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Eif3aP23116 Gm10259-201ENSMUST00000091289 1590 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
Eif3aP23116 Atp2b4-201ENSMUST00000048953 8292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Eif3aP23116 Olfr1293-ps-201ENSMUST00000102551 888 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Eif3aP23116 Slc35a5-202ENSMUST00000114600 679 ntTSL 3 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Eif3aP23116 Gm15203-201ENSMUST00000117668 455 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
Eif3aP23116 Gm7910-201ENSMUST00000117896 835 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
Eif3aP23116 Gm22275-201ENSMUST00000122470 310 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
Eif3aP23116 AV064505-201ENSMUST00000124572 522 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Eif3aP23116 Gm7426-201ENSMUST00000179046 404 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
Eif3aP23116 n-R5s93-201ENSMUST00000180091 119 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
Eif3aP23116 Snhg5-201ENSMUST00000180563 1004 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Eif3aP23116 1700066J03Rik-201ENSMUST00000181908 444 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Eif3aP23116 Gm29331-201ENSMUST00000187215 605 ntTSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Eif3aP23116 Smpx-208ENSMUST00000190091 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Eif3aP23116 4930465I24Rik-201ENSMUST00000209697 426 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Eif3aP23116 Gm35024-201ENSMUST00000213359 972 ntTSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Eif3aP23116 4932702P03Rik-203ENSMUST00000225028 670 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
Eif3aP23116 AC138604.2-201ENSMUST00000226620 921 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
Eif3aP23116 Cbx3-ps4-201ENSMUST00000091531 549 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
Eif3aP23116 Olfr316-202ENSMUST00000215071 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Eif3aP23116 Olfr1241-202ENSMUST00000214743 2328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Eif3aP23116 9930111J21Rik1-202ENSMUST00000097494 3863 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Eif3aP23116 Efhb-201ENSMUST00000024725 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Eif3aP23116 R3hdm2-204ENSMUST00000105250 3975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.98□□□□□ -0.97
Eif3aP23116 Gm43533-201ENSMUST00000202933 2936 ntBASIC8.98□□□□□ -0.97
Eif3aP23116 Gucy1b2-203ENSMUST00000165651 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Eif3aP23116 Zfp2-201ENSMUST00000109128 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Eif3aP23116 Calcr-205ENSMUST00000171613 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Eif3aP23116 Trim30c-201ENSMUST00000106828 1716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.98□□□□□ -0.97
Eif3aP23116 Gm26744-201ENSMUST00000181834 1731 ntTSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Eif3aP23116 Fetub-202ENSMUST00000116625 1338 ntTSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Eif3aP23116 Ankrd66-201ENSMUST00000178772 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.98□□□□□ -0.97
Eif3aP23116 Ubl7-209ENSMUST00000216925 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Eif3aP23116 Gm3752-201ENSMUST00000164366 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.98□□□□□ -0.97
Eif3aP23116 Kif20a-201ENSMUST00000166044 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Eif3aP23116 Kif20a-202ENSMUST00000167161 3565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Eif3aP23116 Vmn1r197-202ENSMUST00000226225 5326 ntAPPRIS P1 BASIC8.98□□□□□ -0.97
Eif3aP23116 Gm29761-201ENSMUST00000215964 1939 ntBASIC8.98□□□□□ -0.97
Eif3aP23116 Zkscan16-201ENSMUST00000107554 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.98□□□□□ -0.97
Eif3aP23116 Gm12346-201ENSMUST00000121455 2255 ntBASIC8.98□□□□□ -0.97
Eif3aP23116 Oxtr-202ENSMUST00000204027 3721 ntTSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Eif3aP23116 H2al2a-201ENSMUST00000105001 542 ntAPPRIS P1 BASIC8.98□□□□□ -0.97
Eif3aP23116 Gm13871-201ENSMUST00000107318 936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.98□□□□□ -0.97
Eif3aP23116 Gm11757-201ENSMUST00000107320 936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.98□□□□□ -0.97
Eif3aP23116 Gm11758-201ENSMUST00000107326 936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.98□□□□□ -0.97
Eif3aP23116 Zfp966-202ENSMUST00000109018 733 ntTSL 3 BASIC8.98□□□□□ -0.97
Eif3aP23116 Zfp968-202ENSMUST00000109048 733 ntTSL 3 BASIC8.98□□□□□ -0.97
Eif3aP23116 Apoa2-202ENSMUST00000111319 458 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.98□□□□□ -0.97
Eif3aP23116 Gm11864-201ENSMUST00000116179 1220 ntBASIC8.98□□□□□ -0.97
Eif3aP23116 Gm12920-201ENSMUST00000121818 1186 ntBASIC8.98□□□□□ -0.97
Eif3aP23116 Gm12145-201ENSMUST00000142108 217 ntTSL 3 BASIC8.98□□□□□ -0.97
Eif3aP23116 AU015336-201ENSMUST00000159040 849 ntTSL 5 BASIC8.98□□□□□ -0.97
Eif3aP23116 Gm16026-205ENSMUST00000162923 641 ntBASIC8.98□□□□□ -0.97
Eif3aP23116 Trav12d-3-201ENSMUST00000177703 347 ntAPPRIS P1 BASIC8.98□□□□□ -0.97
Eif3aP23116 Gm8357-201ENSMUST00000181115 1011 ntBASIC8.98□□□□□ -0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.8 ms