Protein–RNA interactions for Protein: F8VPU6

Usp9y, Ubiquitin-specific peptidase 9, Y chromosome, mousemouse

Predictions only

Length 2,556 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9yF8VPU6 Gm25780-201ENSMUST00000122528 253 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Usp9yF8VPU6 Mir1983-201ENSMUST00000157523 132 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Usp9yF8VPU6 Gm25603-201ENSMUST00000158361 105 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Usp9yF8VPU6 Rps12-ps22-201ENSMUST00000179382 402 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Usp9yF8VPU6 Gm27348-201ENSMUST00000184511 170 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Usp9yF8VPU6 Gm29813-201ENSMUST00000195856 447 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Usp9yF8VPU6 Klk1b12-ps-201ENSMUST00000206650 751 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Usp9yF8VPU6 Cldn34b2-201ENSMUST00000076671 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Usp9yF8VPU6 Flrt3-201ENSMUST00000056760 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Usp9yF8VPU6 Itk-201ENSMUST00000020664 4272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Usp9yF8VPU6 Olfr319-203ENSMUST00000215962 2500 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Usp9yF8VPU6 Hmcn2-201ENSMUST00000113532 15646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Usp9yF8VPU6 Gm36737-201ENSMUST00000209653 2189 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Usp9yF8VPU6 Cdk12-202ENSMUST00000107538 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Usp9yF8VPU6 Fam60a-211ENSMUST00000204435 2785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Usp9yF8VPU6 Gpr63-201ENSMUST00000038920 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
Usp9yF8VPU6 Lig3-211ENSMUST00000173722 5797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Usp9yF8VPU6 Gm26945-201ENSMUST00000183191 2011 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Usp9yF8VPU6 Vps39-202ENSMUST00000102501 4384 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
Usp9yF8VPU6 3632451O06Rik-202ENSMUST00000118129 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
Usp9yF8VPU6 Gm38380-201ENSMUST00000195718 2248 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Usp9yF8VPU6 Ccdc7a-202ENSMUST00000108747 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
Usp9yF8VPU6 Gm10286-201ENSMUST00000093603 5077 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Usp9yF8VPU6 Nr6a1-201ENSMUST00000076275 5941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
Usp9yF8VPU6 Tifab-202ENSMUST00000225063 2718 ntAPPRIS P1 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Usp9yF8VPU6 Gm9030-201ENSMUST00000218405 2410 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Usp9yF8VPU6 Gm9029-201ENSMUST00000219232 2410 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Usp9yF8VPU6 Cdh23-201ENSMUST00000073242 10688 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Usp9yF8VPU6 Dclre1b-202ENSMUST00000063502 4113 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
Usp9yF8VPU6 Nup98-203ENSMUST00000210682 6694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Usp9yF8VPU6 Gm17170-201ENSMUST00000112785 316 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Usp9yF8VPU6 Gm16161-201ENSMUST00000162239 290 ntTSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Usp9yF8VPU6 Gm20738-201ENSMUST00000177666 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
Usp9yF8VPU6 Gm20823-201ENSMUST00000179949 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
Usp9yF8VPU6 Gm20865-202ENSMUST00000181163 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
Usp9yF8VPU6 Mirg-204ENSMUST00000182185 3822 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Usp9yF8VPU6 Lockd-204ENSMUST00000184991 243 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Usp9yF8VPU6 Gm21868-201ENSMUST00000185623 1230 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
Usp9yF8VPU6 Gm29049-201ENSMUST00000185705 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
Usp9yF8VPU6 Gm20924-202ENSMUST00000186910 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
Usp9yF8VPU6 Scgb2b33-201ENSMUST00000187413 334 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Usp9yF8VPU6 Gm20816-202ENSMUST00000187846 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
Usp9yF8VPU6 Gm20809-202ENSMUST00000187943 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
Usp9yF8VPU6 Gm20932-201ENSMUST00000189115 694 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Usp9yF8VPU6 Gm20803-202ENSMUST00000190968 1230 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
Usp9yF8VPU6 Gm20867-202ENSMUST00000190987 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
Usp9yF8VPU6 Gm37475-201ENSMUST00000193107 1015 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Usp9yF8VPU6 Gm22362-201ENSMUST00000083102 134 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Usp9yF8VPU6 Spata22-202ENSMUST00000092926 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
Usp9yF8VPU6 Drp2-203ENSMUST00000113226 3499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Usp9yF8VPU6 AC123705.1-201ENSMUST00000222512 2058 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Usp9yF8VPU6 Blm-202ENSMUST00000170315 4770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
Usp9yF8VPU6 Celf2-221ENSMUST00000182706 2525 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
Usp9yF8VPU6 Ptbp2-207ENSMUST00000197464 1742 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
Usp9yF8VPU6 Gm45753-201ENSMUST00000116473 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Usp9yF8VPU6 Hrh2-201ENSMUST00000038101 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
Usp9yF8VPU6 Zmat3-201ENSMUST00000029199 7797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Usp9yF8VPU6 Mllt3-202ENSMUST00000126353 1956 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
Usp9yF8VPU6 Cwc22-201ENSMUST00000065889 3471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
Usp9yF8VPU6 Eif2ak4-206ENSMUST00000110874 5298 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Usp9yF8VPU6 Mbnl1-218ENSMUST00000194069 5460 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
Usp9yF8VPU6 Ndufb8-209ENSMUST00000171415 2142 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
Usp9yF8VPU6 Olfr342-202ENSMUST00000216275 3818 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Usp9yF8VPU6 Itpr1-201ENSMUST00000032192 9870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
Usp9yF8VPU6 Gucy2c-201ENSMUST00000032338 3959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
Usp9yF8VPU6 Hmgcs1-202ENSMUST00000224188 3464 ntAPPRIS P1 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Usp9yF8VPU6 Arsg-203ENSMUST00000106697 3232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Usp9yF8VPU6 Gm13110-201ENSMUST00000138077 3414 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
Usp9yF8VPU6 Zfp677-201ENSMUST00000056107 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
Usp9yF8VPU6 Musk-208ENSMUST00000179951 3376 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Usp9yF8VPU6 Gm2178-201ENSMUST00000104927 357 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Usp9yF8VPU6 Klhl10-202ENSMUST00000107395 932 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
Usp9yF8VPU6 A730017C20Rik-203ENSMUST00000118510 785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Usp9yF8VPU6 Gm14612-201ENSMUST00000121522 881 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Usp9yF8VPU6 Gm6044-201ENSMUST00000121819 499 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Usp9yF8VPU6 Gm25219-201ENSMUST00000157545 330 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Usp9yF8VPU6 Gm22847-201ENSMUST00000157707 105 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Usp9yF8VPU6 Csde1-211ENSMUST00000198180 3849 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
Usp9yF8VPU6 Lsm5-205ENSMUST00000203958 416 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Usp9yF8VPU6 Gm4668-201ENSMUST00000214742 943 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
Usp9yF8VPU6 CT030166.4-201ENSMUST00000220640 404 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Usp9yF8VPU6 AC158981.1-201ENSMUST00000226943 1205 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Usp9yF8VPU6 CT009556.1-201ENSMUST00000227282 449 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Usp9yF8VPU6 Defa29-201ENSMUST00000098890 508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
Usp9yF8VPU6 Afap1l2-201ENSMUST00000111584 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
Usp9yF8VPU6 Als2-201ENSMUST00000027178 6342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
Usp9yF8VPU6 Ppfibp2-201ENSMUST00000040056 3310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
Usp9yF8VPU6 Zfp90-205ENSMUST00000212874 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
Usp9yF8VPU6 Gm44802-201ENSMUST00000208026 1916 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Usp9yF8VPU6 Rian-202ENSMUST00000181253 2355 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
Usp9yF8VPU6 Tlr1-202ENSMUST00000197315 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
Usp9yF8VPU6 Gm43910-201ENSMUST00000204561 3241 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Usp9yF8VPU6 Pvt1-203ENSMUST00000181657 2798 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Usp9yF8VPU6 Wdr76-201ENSMUST00000028676 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
Usp9yF8VPU6 Rad51b-202ENSMUST00000171210 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
Usp9yF8VPU6 Kpna2-201ENSMUST00000018506 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
Usp9yF8VPU6 Unc5c-204ENSMUST00000130636 3595 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
Usp9yF8VPU6 Rnf222-201ENSMUST00000065213 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Usp9yF8VPU6 Dst-205ENSMUST00000182314 2643 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Usp9yF8VPU6 Cat-201ENSMUST00000028610 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
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