Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0Y1

Dctn3, Dynactin subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 186 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dctn3Q9Z0Y1 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Dctn3Q9Z0Y1 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Dctn3Q9Z0Y1 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Dctn3Q9Z0Y1 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Dctn3Q9Z0Y1 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Dctn3Q9Z0Y1 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Dctn3Q9Z0Y1 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Dctn3Q9Z0Y1 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Dctn3Q9Z0Y1 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Dctn3Q9Z0Y1 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Dctn3Q9Z0Y1 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Dctn3Q9Z0Y1 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Dctn3Q9Z0Y1 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Dctn3Q9Z0Y1 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Dctn3Q9Z0Y1 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Dctn3Q9Z0Y1 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Dctn3Q9Z0Y1 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Dctn3Q9Z0Y1 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Dctn3Q9Z0Y1 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Dctn3Q9Z0Y1 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Dctn3Q9Z0Y1 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Dctn3Q9Z0Y1 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Dctn3Q9Z0Y1 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Dctn3Q9Z0Y1 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Dctn3Q9Z0Y1 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Dctn3Q9Z0Y1 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Dctn3Q9Z0Y1 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Dctn3Q9Z0Y1 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Dctn3Q9Z0Y1 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Dctn3Q9Z0Y1 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Dctn3Q9Z0Y1 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Dctn3Q9Z0Y1 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Dctn3Q9Z0Y1 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Dctn3Q9Z0Y1 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Dctn3Q9Z0Y1 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Dctn3Q9Z0Y1 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Dctn3Q9Z0Y1 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Dctn3Q9Z0Y1 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Dctn3Q9Z0Y1 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Dctn3Q9Z0Y1 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Dctn3Q9Z0Y1 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Dctn3Q9Z0Y1 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Dctn3Q9Z0Y1 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Dctn3Q9Z0Y1 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Dctn3Q9Z0Y1 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Dctn3Q9Z0Y1 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Dctn3Q9Z0Y1 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Dctn3Q9Z0Y1 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Dctn3Q9Z0Y1 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Dctn3Q9Z0Y1 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Dctn3Q9Z0Y1 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Dctn3Q9Z0Y1 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Dctn3Q9Z0Y1 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Dctn3Q9Z0Y1 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Dctn3Q9Z0Y1 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Dctn3Q9Z0Y1 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Dctn3Q9Z0Y1 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Dctn3Q9Z0Y1 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Dctn3Q9Z0Y1 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Dctn3Q9Z0Y1 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Dctn3Q9Z0Y1 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Dctn3Q9Z0Y1 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Dctn3Q9Z0Y1 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Dctn3Q9Z0Y1 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Dctn3Q9Z0Y1 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Dctn3Q9Z0Y1 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Dctn3Q9Z0Y1 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Dctn3Q9Z0Y1 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Dctn3Q9Z0Y1 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Dctn3Q9Z0Y1 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Dctn3Q9Z0Y1 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Dctn3Q9Z0Y1 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Dctn3Q9Z0Y1 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Dctn3Q9Z0Y1 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Dctn3Q9Z0Y1 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Dctn3Q9Z0Y1 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Dctn3Q9Z0Y1 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Dctn3Q9Z0Y1 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Dctn3Q9Z0Y1 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Dctn3Q9Z0Y1 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Dctn3Q9Z0Y1 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Dctn3Q9Z0Y1 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Dctn3Q9Z0Y1 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Dctn3Q9Z0Y1 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Dctn3Q9Z0Y1 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Dctn3Q9Z0Y1 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Dctn3Q9Z0Y1 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Dctn3Q9Z0Y1 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Dctn3Q9Z0Y1 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Dctn3Q9Z0Y1 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Dctn3Q9Z0Y1 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Dctn3Q9Z0Y1 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Dctn3Q9Z0Y1 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Dctn3Q9Z0Y1 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Dctn3Q9Z0Y1 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Dctn3Q9Z0Y1 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Dctn3Q9Z0Y1 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Dctn3Q9Z0Y1 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Dctn3Q9Z0Y1 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Dctn3Q9Z0Y1 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms