Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUA2

Farsb, Phenylalanine--tRNA ligase beta subunit, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 589 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FarsbQ9WUA2 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
FarsbQ9WUA2 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
FarsbQ9WUA2 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
FarsbQ9WUA2 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
FarsbQ9WUA2 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
FarsbQ9WUA2 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
FarsbQ9WUA2 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
FarsbQ9WUA2 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
FarsbQ9WUA2 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
FarsbQ9WUA2 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
FarsbQ9WUA2 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
FarsbQ9WUA2 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
FarsbQ9WUA2 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
FarsbQ9WUA2 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
FarsbQ9WUA2 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
FarsbQ9WUA2 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
FarsbQ9WUA2 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
FarsbQ9WUA2 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
FarsbQ9WUA2 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
FarsbQ9WUA2 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
FarsbQ9WUA2 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
FarsbQ9WUA2 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
FarsbQ9WUA2 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
FarsbQ9WUA2 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
FarsbQ9WUA2 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
FarsbQ9WUA2 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
FarsbQ9WUA2 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
FarsbQ9WUA2 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
FarsbQ9WUA2 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
FarsbQ9WUA2 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
FarsbQ9WUA2 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
FarsbQ9WUA2 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
FarsbQ9WUA2 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
FarsbQ9WUA2 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
FarsbQ9WUA2 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
FarsbQ9WUA2 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
FarsbQ9WUA2 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
FarsbQ9WUA2 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
FarsbQ9WUA2 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
FarsbQ9WUA2 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
FarsbQ9WUA2 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
FarsbQ9WUA2 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
FarsbQ9WUA2 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
FarsbQ9WUA2 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
FarsbQ9WUA2 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
FarsbQ9WUA2 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
FarsbQ9WUA2 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
FarsbQ9WUA2 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
FarsbQ9WUA2 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
FarsbQ9WUA2 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
FarsbQ9WUA2 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FarsbQ9WUA2 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FarsbQ9WUA2 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FarsbQ9WUA2 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FarsbQ9WUA2 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FarsbQ9WUA2 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FarsbQ9WUA2 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FarsbQ9WUA2 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FarsbQ9WUA2 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
FarsbQ9WUA2 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
FarsbQ9WUA2 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
FarsbQ9WUA2 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FarsbQ9WUA2 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FarsbQ9WUA2 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
FarsbQ9WUA2 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FarsbQ9WUA2 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
FarsbQ9WUA2 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FarsbQ9WUA2 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FarsbQ9WUA2 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FarsbQ9WUA2 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
FarsbQ9WUA2 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FarsbQ9WUA2 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FarsbQ9WUA2 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FarsbQ9WUA2 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FarsbQ9WUA2 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FarsbQ9WUA2 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FarsbQ9WUA2 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FarsbQ9WUA2 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
FarsbQ9WUA2 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
FarsbQ9WUA2 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
FarsbQ9WUA2 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
FarsbQ9WUA2 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
FarsbQ9WUA2 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
FarsbQ9WUA2 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
FarsbQ9WUA2 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
FarsbQ9WUA2 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
FarsbQ9WUA2 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
FarsbQ9WUA2 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
FarsbQ9WUA2 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
FarsbQ9WUA2 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
FarsbQ9WUA2 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
FarsbQ9WUA2 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
FarsbQ9WUA2 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
FarsbQ9WUA2 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
FarsbQ9WUA2 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
FarsbQ9WUA2 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
FarsbQ9WUA2 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
FarsbQ9WUA2 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
FarsbQ9WUA2 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
FarsbQ9WUA2 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.9 ms