Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1P4

Psma1, Proteasome subunit alpha type-1, mousemouse

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psma1Q9R1P4 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Psma1Q9R1P4 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Psma1Q9R1P4 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Psma1Q9R1P4 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Psma1Q9R1P4 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Psma1Q9R1P4 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Psma1Q9R1P4 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Psma1Q9R1P4 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Psma1Q9R1P4 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Psma1Q9R1P4 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Psma1Q9R1P4 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Psma1Q9R1P4 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Psma1Q9R1P4 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Psma1Q9R1P4 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Psma1Q9R1P4 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Psma1Q9R1P4 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Psma1Q9R1P4 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Psma1Q9R1P4 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Psma1Q9R1P4 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Psma1Q9R1P4 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Psma1Q9R1P4 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Psma1Q9R1P4 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Psma1Q9R1P4 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Psma1Q9R1P4 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Psma1Q9R1P4 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Psma1Q9R1P4 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Psma1Q9R1P4 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Psma1Q9R1P4 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Psma1Q9R1P4 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Psma1Q9R1P4 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Psma1Q9R1P4 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
Psma1Q9R1P4 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Psma1Q9R1P4 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Psma1Q9R1P4 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Psma1Q9R1P4 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Psma1Q9R1P4 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Psma1Q9R1P4 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Psma1Q9R1P4 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Psma1Q9R1P4 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Psma1Q9R1P4 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Psma1Q9R1P4 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Psma1Q9R1P4 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Psma1Q9R1P4 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Psma1Q9R1P4 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Psma1Q9R1P4 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Psma1Q9R1P4 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Psma1Q9R1P4 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Psma1Q9R1P4 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Psma1Q9R1P4 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Psma1Q9R1P4 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Psma1Q9R1P4 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Psma1Q9R1P4 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Psma1Q9R1P4 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Psma1Q9R1P4 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Psma1Q9R1P4 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Psma1Q9R1P4 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Psma1Q9R1P4 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Psma1Q9R1P4 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Psma1Q9R1P4 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Psma1Q9R1P4 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Psma1Q9R1P4 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Psma1Q9R1P4 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Psma1Q9R1P4 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Psma1Q9R1P4 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Psma1Q9R1P4 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Psma1Q9R1P4 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Psma1Q9R1P4 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Psma1Q9R1P4 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Psma1Q9R1P4 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Psma1Q9R1P4 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Psma1Q9R1P4 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Psma1Q9R1P4 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Psma1Q9R1P4 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Psma1Q9R1P4 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Psma1Q9R1P4 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Psma1Q9R1P4 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Psma1Q9R1P4 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Psma1Q9R1P4 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Psma1Q9R1P4 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Psma1Q9R1P4 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Psma1Q9R1P4 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Psma1Q9R1P4 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Psma1Q9R1P4 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Psma1Q9R1P4 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Psma1Q9R1P4 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Psma1Q9R1P4 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Psma1Q9R1P4 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Psma1Q9R1P4 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Psma1Q9R1P4 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Psma1Q9R1P4 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Psma1Q9R1P4 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Psma1Q9R1P4 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Psma1Q9R1P4 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Psma1Q9R1P4 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Psma1Q9R1P4 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Psma1Q9R1P4 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Psma1Q9R1P4 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Psma1Q9R1P4 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Psma1Q9R1P4 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Psma1Q9R1P4 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.4 ms