Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYG8

KCNK4, Potassium channel subfamily K member 4, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNK4Q9NYG8 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
KCNK4Q9NYG8 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
KCNK4Q9NYG8 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
KCNK4Q9NYG8 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
KCNK4Q9NYG8 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
KCNK4Q9NYG8 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
KCNK4Q9NYG8 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
KCNK4Q9NYG8 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
KCNK4Q9NYG8 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
KCNK4Q9NYG8 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
KCNK4Q9NYG8 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
KCNK4Q9NYG8 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
KCNK4Q9NYG8 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
KCNK4Q9NYG8 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
KCNK4Q9NYG8 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
KCNK4Q9NYG8 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
KCNK4Q9NYG8 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
KCNK4Q9NYG8 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
KCNK4Q9NYG8 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
KCNK4Q9NYG8 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
KCNK4Q9NYG8 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
KCNK4Q9NYG8 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
KCNK4Q9NYG8 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
KCNK4Q9NYG8 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
KCNK4Q9NYG8 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
KCNK4Q9NYG8 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
KCNK4Q9NYG8 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
KCNK4Q9NYG8 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
KCNK4Q9NYG8 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
KCNK4Q9NYG8 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
KCNK4Q9NYG8 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
KCNK4Q9NYG8 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
KCNK4Q9NYG8 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
KCNK4Q9NYG8 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
KCNK4Q9NYG8 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
KCNK4Q9NYG8 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
KCNK4Q9NYG8 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
KCNK4Q9NYG8 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
KCNK4Q9NYG8 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
KCNK4Q9NYG8 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
KCNK4Q9NYG8 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
KCNK4Q9NYG8 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
KCNK4Q9NYG8 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
KCNK4Q9NYG8 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
KCNK4Q9NYG8 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
KCNK4Q9NYG8 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
KCNK4Q9NYG8 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
KCNK4Q9NYG8 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
KCNK4Q9NYG8 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
KCNK4Q9NYG8 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
KCNK4Q9NYG8 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
KCNK4Q9NYG8 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
KCNK4Q9NYG8 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
KCNK4Q9NYG8 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
KCNK4Q9NYG8 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
KCNK4Q9NYG8 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
KCNK4Q9NYG8 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
KCNK4Q9NYG8 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
KCNK4Q9NYG8 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
KCNK4Q9NYG8 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
KCNK4Q9NYG8 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
KCNK4Q9NYG8 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
KCNK4Q9NYG8 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
KCNK4Q9NYG8 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
KCNK4Q9NYG8 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC21.18■□□□□ 0.98
KCNK4Q9NYG8 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
KCNK4Q9NYG8 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
KCNK4Q9NYG8 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
KCNK4Q9NYG8 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
KCNK4Q9NYG8 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
KCNK4Q9NYG8 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
KCNK4Q9NYG8 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
KCNK4Q9NYG8 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC21.17■□□□□ 0.98
KCNK4Q9NYG8 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
KCNK4Q9NYG8 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
KCNK4Q9NYG8 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
KCNK4Q9NYG8 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
KCNK4Q9NYG8 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
KCNK4Q9NYG8 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
KCNK4Q9NYG8 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
KCNK4Q9NYG8 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
KCNK4Q9NYG8 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
KCNK4Q9NYG8 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
KCNK4Q9NYG8 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
KCNK4Q9NYG8 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
KCNK4Q9NYG8 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
KCNK4Q9NYG8 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
KCNK4Q9NYG8 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
KCNK4Q9NYG8 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
KCNK4Q9NYG8 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
KCNK4Q9NYG8 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
KCNK4Q9NYG8 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
KCNK4Q9NYG8 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
KCNK4Q9NYG8 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
KCNK4Q9NYG8 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
KCNK4Q9NYG8 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
KCNK4Q9NYG8 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
KCNK4Q9NYG8 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
KCNK4Q9NYG8 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
KCNK4Q9NYG8 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms