Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRR4

DROSHA, Ribonuclease 3, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 1,374 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DROSHAQ9NRR4 SSBP2-210ENST00000508912 256 ntTSL 29.36□□□□□ -0.917e-7■■■■□ 22.1
DROSHAQ9NRR4 SSBP2-206ENST00000506960 685 ntTSL 23.22□□□□□ -1.897e-7■■■■□ 22.1
DROSHAQ9NRR4 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC39.42■■■■□ 3.92e-7■■■■□ 22.1
DROSHAQ9NRR4 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC39.42■■■■□ 3.92e-7■■■■□ 22.1
DROSHAQ9NRR4 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC39.09■■■■□ 3.852e-7■■■■□ 22.1
DROSHAQ9NRR4 MAZ-211ENST00000567444 635 ntTSL 236■■■■□ 3.354e-7■■■■□ 22.1
DROSHAQ9NRR4 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.222e-7■■■■□ 22.1
DROSHAQ9NRR4 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.072e-7■■■■□ 22.1
DROSHAQ9NRR4 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.784e-8■■■■□ 22.1
DROSHAQ9NRR4 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC32.06■■■□□ 2.723e-7■■■■□ 22.1
DROSHAQ9NRR4 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.672e-7■■■■□ 22.1
DROSHAQ9NRR4 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC31.57■■■□□ 2.642e-6■■■■□ 22.1
DROSHAQ9NRR4 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.644e-7■■■■□ 22.1
DROSHAQ9NRR4 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC30.88■■■□□ 2.532e-7■■■■□ 22.1
DROSHAQ9NRR4 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.88■■■□□ 2.534e-8■■■■□ 22.1
DROSHAQ9NRR4 MAZ-207ENST00000563012 646 ntTSL 330.75■■■□□ 2.513e-7■■■■□ 22.1
DROSHAQ9NRR4 ZNF148-204ENST00000471196 566 ntTSL 430.25■■■□□ 2.434e-7■■■■□ 22.1
DROSHAQ9NRR4 ARFGAP1-211ENST00000519531 1490 ntTSL 327.52■■■□□ 22e-6■■■■□ 22.1
DROSHAQ9NRR4 ZNF644-208ENST00000482467 710 ntTSL 526.82■■□□□ 1.882e-6■■■■□ 22.1
DROSHAQ9NRR4 YY1AP1-218ENST00000454523 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 225.97■■□□□ 1.754e-8■■■■□ 22.1
DROSHAQ9NRR4 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.734e-8■■■■□ 22.1
DROSHAQ9NRR4 MAZ-213ENST00000568411 599 ntTSL 325.06■■□□□ 1.62e-7■■■■□ 22.1
DROSHAQ9NRR4 YY1AP1-217ENST00000443231 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 324.82■■□□□ 1.564e-8■■■■□ 22.1
DROSHAQ9NRR4 YY1AP1-221ENST00000476093 1037 ntTSL 324.49■■□□□ 1.514e-8■■■■□ 22.1
DROSHAQ9NRR4 YY1AP1-207ENST00000361140 2701 ntTSL 1 (best)23.53■■□□□ 1.364e-8■■■■□ 22.1
DROSHAQ9NRR4 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.231e-12■■■■□ 22.1
DROSHAQ9NRR4 FBXO31-202ENST00000561664 305 ntTSL 522.43■■□□□ 1.182e-6■■■■□ 22.1
DROSHAQ9NRR4 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.184e-8■■■■□ 22.1
DROSHAQ9NRR4 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.124e-8■■■■□ 22.1
DROSHAQ9NRR4 ZNF644-211ENST00000498303 514 ntTSL 1 (best)21.79■■□□□ 1.082e-6■■■■□ 22.1
DROSHAQ9NRR4 MAZ-204ENST00000561855 672 ntTSL 521.65■■□□□ 1.063e-7■■■■□ 22.1
DROSHAQ9NRR4 YY1AP1-220ENST00000476027 927 ntTSL 321.12■□□□□ 0.974e-8■■■■□ 22.1
DROSHAQ9NRR4 STAG3L1-204ENST00000619870 1192 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.952e-6■■■■□ 22.1
DROSHAQ9NRR4 CEP112-202ENST00000392769 3517 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.822e-6■■■■□ 22.1
DROSHAQ9NRR4 MAZ-206ENST00000562557 475 ntTSL 320.03■□□□□ 0.83e-7■■■■□ 22.1
DROSHAQ9NRR4 YY1AP1-208ENST00000361831 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.764e-8■■■■□ 22.1
DROSHAQ9NRR4 YY1AP1-205ENST00000355499 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.734e-8■■■■□ 22.1
DROSHAQ9NRR4 YY1AP1-209ENST00000368330 2555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.314e-8■■■■□ 22.1
DROSHAQ9NRR4 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.312e-6■■■■□ 22.1
DROSHAQ9NRR4 YY1AP1-204ENST00000354691 2498 ntTSL 216.31■□□□□ 0.24e-8■■■■□ 22.1
DROSHAQ9NRR4 ZNF148-206ENST00000485866 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.144e-7■■■■□ 22.1
DROSHAQ9NRR4 CEP112-203ENST00000535342 3392 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.032e-6■■■■□ 22.1
DROSHAQ9NRR4 ZNF148-205ENST00000484491 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.044e-7■■■■□ 22.1
DROSHAQ9NRR4 ZNF148-207ENST00000492394 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.344e-7■■■■□ 22.1
DROSHAQ9NRR4 STAG3L1-201ENST00000404291 496 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.352e-6■■■■□ 22.1
DROSHAQ9NRR4 YY1AP1-203ENST00000347088 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.394e-8■■■■□ 22.1
DROSHAQ9NRR4 DOCK1-204ENST00000484400 779 ntTSL 312.3□□□□□ -0.442e-6■■■■□ 22.1
DROSHAQ9NRR4 YY1AP1-215ENST00000436865 2684 ntTSL 1 (best)12.03□□□□□ -0.484e-8■■■■□ 22.1
DROSHAQ9NRR4 ZNF644-210ENST00000495966 820 ntTSL 311.45□□□□□ -0.582e-6■■■■□ 22.1
DROSHAQ9NRR4 DOCK1-202ENST00000464466 323 ntTSL 310.77□□□□□ -0.692e-6■■■■□ 22.1
DROSHAQ9NRR4 EPPK1-202ENST00000615648 16002 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.711e-6■■■■□ 22.1
DROSHAQ9NRR4 ZNF148-201ENST00000360647 9651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.184e-7■■■■□ 22.1
DROSHAQ9NRR4 CEP112-204ENST00000537949 2847 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.222e-6■■■■□ 22.1
DROSHAQ9NRR4 ZNF644-205ENST00000467231 851 ntTSL 32.56□□□□□ -22e-6■■■■□ 22.1
DROSHAQ9NRR4 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.773e-7■■■■□ 22.1
DROSHAQ9NRR4 MYL6-216ENST00000550184 1564 ntTSL 522.44■■□□□ 1.183e-7■■■■□ 22.1
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DROSHAQ9NRR4 MYL6-207ENST00000547649 655 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.123e-7■■■■□ 22.1
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DROSHAQ9NRR4 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.952e-6■■■■□ 22.1
DROSHAQ9NRR4 IMPDH1-204ENST00000419067 2431 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.932e-6■■■■□ 22.1
DROSHAQ9NRR4 IMPDH1-211ENST00000484496 2422 ntTSL 519.72■□□□□ 0.752e-6■■■■□ 22.1
DROSHAQ9NRR4 KDM5B-202ENST00000367264 6449 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.167e-8■■■■□ 22.1
DROSHAQ9NRR4 KDM5B-203ENST00000367265 10345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.197e-8■■■■□ 22.1
DROSHAQ9NRR4 KDM5B-210ENST00000602511 542 ntTSL 512.58□□□□□ -0.47e-8■■■■□ 22.1
DROSHAQ9NRR4 C1orf159-219ENST00000487177 3315 ntTSL 222.11■■□□□ 1.133e-6■■■■□ 22.1
DROSHAQ9NRR4 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.853e-6■■■■□ 22.1
DROSHAQ9NRR4 INTS11-223ENST00000498173 1589 ntTSL 232.91■■■□□ 2.861e-7■■■■□ 22.1
DROSHAQ9NRR4 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC32.03■■■□□ 2.721e-7■■■■□ 22.1
DROSHAQ9NRR4 INTS11-221ENST00000496353 2428 ntTSL 226.7■■□□□ 1.861e-7■■■■□ 22.1
DROSHAQ9NRR4 LARP1-208ENST00000518892 399 ntTSL 332.66■■■□□ 2.826e-9■■■■□ 22
DROSHAQ9NRR4 LARP1-202ENST00000517616 501 ntTSL 52.83□□□□□ -1.966e-9■■■■□ 22
DROSHAQ9NRR4 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC39.73■■■■□ 3.956e-6■■■■□ 22
DROSHAQ9NRR4 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.356e-6■■■■□ 22
DROSHAQ9NRR4 RNF166-205ENST00000562544 502 ntTSL 526.07■■□□□ 1.766e-6■■■■□ 22
DROSHAQ9NRR4 RNH1-210ENST00000525701 1794 ntTSL 531.66■■■□□ 2.663e-6■■■■□ 22
DROSHAQ9NRR4 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.39■■■□□ 2.623e-6■■■■□ 22
DROSHAQ9NRR4 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.523e-6■■■■□ 22
DROSHAQ9NRR4 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.513e-6■■■■□ 22
DROSHAQ9NRR4 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.393e-6■■■■□ 22
DROSHAQ9NRR4 RNH1-213ENST00000528713 1202 ntTSL 1 (best)28.7■■■□□ 2.183e-6■■■■□ 22
DROSHAQ9NRR4 RNH1-207ENST00000524464 624 ntTSL 527.7■■■□□ 2.023e-6■■■■□ 22
DROSHAQ9NRR4 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.953e-6■■■■□ 22
DROSHAQ9NRR4 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.793e-6■■■■□ 22
DROSHAQ9NRR4 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.783e-6■■■■□ 22
DROSHAQ9NRR4 RNH1-212ENST00000527485 873 ntTSL 224.35■■□□□ 1.493e-6■■■■□ 22
DROSHAQ9NRR4 RNH1-215ENST00000529306 870 ntTSL 324.35■■□□□ 1.493e-6■■■■□ 22
DROSHAQ9NRR4 RNH1-218ENST00000531149 709 ntTSL 324.03■■□□□ 1.443e-6■■■■□ 22
DROSHAQ9NRR4 RNH1-214ENST00000529115 855 ntTSL 323.45■■□□□ 1.343e-6■■■■□ 22
DROSHAQ9NRR4 RNH1-208ENST00000524780 1059 ntTSL 220.69■□□□□ 0.93e-6■■■■□ 22
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