Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPC8

SIX2, Homeobox protein SIX2, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX2Q9NPC8 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SIX2Q9NPC8 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SIX2Q9NPC8 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SIX2Q9NPC8 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SIX2Q9NPC8 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SIX2Q9NPC8 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SIX2Q9NPC8 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SIX2Q9NPC8 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SIX2Q9NPC8 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SIX2Q9NPC8 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SIX2Q9NPC8 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SIX2Q9NPC8 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SIX2Q9NPC8 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SIX2Q9NPC8 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SIX2Q9NPC8 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SIX2Q9NPC8 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SIX2Q9NPC8 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SIX2Q9NPC8 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SIX2Q9NPC8 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SIX2Q9NPC8 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SIX2Q9NPC8 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SIX2Q9NPC8 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SIX2Q9NPC8 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SIX2Q9NPC8 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SIX2Q9NPC8 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SIX2Q9NPC8 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SIX2Q9NPC8 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SIX2Q9NPC8 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SIX2Q9NPC8 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SIX2Q9NPC8 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SIX2Q9NPC8 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SIX2Q9NPC8 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SIX2Q9NPC8 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SIX2Q9NPC8 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SIX2Q9NPC8 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SIX2Q9NPC8 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SIX2Q9NPC8 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SIX2Q9NPC8 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
SIX2Q9NPC8 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SIX2Q9NPC8 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SIX2Q9NPC8 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SIX2Q9NPC8 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SIX2Q9NPC8 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SIX2Q9NPC8 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SIX2Q9NPC8 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SIX2Q9NPC8 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SIX2Q9NPC8 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SIX2Q9NPC8 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SIX2Q9NPC8 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SIX2Q9NPC8 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SIX2Q9NPC8 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SIX2Q9NPC8 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SIX2Q9NPC8 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SIX2Q9NPC8 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SIX2Q9NPC8 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SIX2Q9NPC8 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SIX2Q9NPC8 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SIX2Q9NPC8 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SIX2Q9NPC8 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SIX2Q9NPC8 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SIX2Q9NPC8 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SIX2Q9NPC8 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SIX2Q9NPC8 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SIX2Q9NPC8 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SIX2Q9NPC8 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SIX2Q9NPC8 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
SIX2Q9NPC8 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SIX2Q9NPC8 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SIX2Q9NPC8 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SIX2Q9NPC8 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SIX2Q9NPC8 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SIX2Q9NPC8 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SIX2Q9NPC8 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SIX2Q9NPC8 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SIX2Q9NPC8 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SIX2Q9NPC8 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SIX2Q9NPC8 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SIX2Q9NPC8 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SIX2Q9NPC8 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SIX2Q9NPC8 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SIX2Q9NPC8 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SIX2Q9NPC8 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SIX2Q9NPC8 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SIX2Q9NPC8 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SIX2Q9NPC8 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SIX2Q9NPC8 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SIX2Q9NPC8 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SIX2Q9NPC8 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SIX2Q9NPC8 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SIX2Q9NPC8 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SIX2Q9NPC8 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
SIX2Q9NPC8 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SIX2Q9NPC8 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SIX2Q9NPC8 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SIX2Q9NPC8 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
SIX2Q9NPC8 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SIX2Q9NPC8 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SIX2Q9NPC8 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SIX2Q9NPC8 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SIX2Q9NPC8 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms