Protein–RNA interactions for Protein: Q9HD43

PTPRH, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase H, humanhuman

Predictions only

Length 1,115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRHQ9HD43 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PTPRHQ9HD43 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PTPRHQ9HD43 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PTPRHQ9HD43 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PTPRHQ9HD43 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PTPRHQ9HD43 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PTPRHQ9HD43 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PTPRHQ9HD43 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PTPRHQ9HD43 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PTPRHQ9HD43 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PTPRHQ9HD43 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PTPRHQ9HD43 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
PTPRHQ9HD43 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PTPRHQ9HD43 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PTPRHQ9HD43 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTPRHQ9HD43 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTPRHQ9HD43 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTPRHQ9HD43 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTPRHQ9HD43 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTPRHQ9HD43 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTPRHQ9HD43 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTPRHQ9HD43 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTPRHQ9HD43 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTPRHQ9HD43 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTPRHQ9HD43 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTPRHQ9HD43 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTPRHQ9HD43 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
PTPRHQ9HD43 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTPRHQ9HD43 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTPRHQ9HD43 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTPRHQ9HD43 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTPRHQ9HD43 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTPRHQ9HD43 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTPRHQ9HD43 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTPRHQ9HD43 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTPRHQ9HD43 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTPRHQ9HD43 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTPRHQ9HD43 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTPRHQ9HD43 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTPRHQ9HD43 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTPRHQ9HD43 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTPRHQ9HD43 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTPRHQ9HD43 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTPRHQ9HD43 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTPRHQ9HD43 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTPRHQ9HD43 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTPRHQ9HD43 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
PTPRHQ9HD43 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTPRHQ9HD43 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTPRHQ9HD43 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTPRHQ9HD43 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
PTPRHQ9HD43 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTPRHQ9HD43 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTPRHQ9HD43 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
PTPRHQ9HD43 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTPRHQ9HD43 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTPRHQ9HD43 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTPRHQ9HD43 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTPRHQ9HD43 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTPRHQ9HD43 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTPRHQ9HD43 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTPRHQ9HD43 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTPRHQ9HD43 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTPRHQ9HD43 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTPRHQ9HD43 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTPRHQ9HD43 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTPRHQ9HD43 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTPRHQ9HD43 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTPRHQ9HD43 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
PTPRHQ9HD43 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTPRHQ9HD43 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTPRHQ9HD43 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
PTPRHQ9HD43 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTPRHQ9HD43 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTPRHQ9HD43 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
PTPRHQ9HD43 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
PTPRHQ9HD43 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTPRHQ9HD43 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTPRHQ9HD43 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTPRHQ9HD43 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTPRHQ9HD43 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTPRHQ9HD43 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTPRHQ9HD43 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTPRHQ9HD43 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTPRHQ9HD43 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTPRHQ9HD43 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTPRHQ9HD43 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTPRHQ9HD43 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTPRHQ9HD43 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTPRHQ9HD43 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTPRHQ9HD43 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTPRHQ9HD43 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTPRHQ9HD43 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTPRHQ9HD43 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTPRHQ9HD43 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTPRHQ9HD43 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTPRHQ9HD43 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTPRHQ9HD43 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTPRHQ9HD43 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTPRHQ9HD43 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms