Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERF3

Wdr61, WD repeat-containing protein 61, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wdr61Q9ERF3 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Wdr61Q9ERF3 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Wdr61Q9ERF3 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Wdr61Q9ERF3 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Wdr61Q9ERF3 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Wdr61Q9ERF3 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Wdr61Q9ERF3 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Wdr61Q9ERF3 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Wdr61Q9ERF3 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Wdr61Q9ERF3 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Wdr61Q9ERF3 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Wdr61Q9ERF3 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Wdr61Q9ERF3 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Wdr61Q9ERF3 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Wdr61Q9ERF3 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Wdr61Q9ERF3 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Wdr61Q9ERF3 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Wdr61Q9ERF3 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Wdr61Q9ERF3 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Wdr61Q9ERF3 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Wdr61Q9ERF3 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Wdr61Q9ERF3 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Wdr61Q9ERF3 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Wdr61Q9ERF3 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Wdr61Q9ERF3 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Wdr61Q9ERF3 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Wdr61Q9ERF3 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Wdr61Q9ERF3 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Wdr61Q9ERF3 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Wdr61Q9ERF3 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Wdr61Q9ERF3 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Wdr61Q9ERF3 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Wdr61Q9ERF3 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Wdr61Q9ERF3 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Wdr61Q9ERF3 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Wdr61Q9ERF3 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Wdr61Q9ERF3 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Wdr61Q9ERF3 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Wdr61Q9ERF3 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Wdr61Q9ERF3 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Wdr61Q9ERF3 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Wdr61Q9ERF3 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Wdr61Q9ERF3 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Wdr61Q9ERF3 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Wdr61Q9ERF3 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Wdr61Q9ERF3 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Wdr61Q9ERF3 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Wdr61Q9ERF3 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Wdr61Q9ERF3 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Wdr61Q9ERF3 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Wdr61Q9ERF3 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Wdr61Q9ERF3 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Wdr61Q9ERF3 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Wdr61Q9ERF3 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Wdr61Q9ERF3 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Wdr61Q9ERF3 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Wdr61Q9ERF3 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Wdr61Q9ERF3 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Wdr61Q9ERF3 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Wdr61Q9ERF3 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Wdr61Q9ERF3 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Wdr61Q9ERF3 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Wdr61Q9ERF3 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Wdr61Q9ERF3 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Wdr61Q9ERF3 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Wdr61Q9ERF3 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Wdr61Q9ERF3 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Wdr61Q9ERF3 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Wdr61Q9ERF3 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Wdr61Q9ERF3 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Wdr61Q9ERF3 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Wdr61Q9ERF3 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Wdr61Q9ERF3 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Wdr61Q9ERF3 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Wdr61Q9ERF3 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Wdr61Q9ERF3 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Wdr61Q9ERF3 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Wdr61Q9ERF3 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Wdr61Q9ERF3 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Wdr61Q9ERF3 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Wdr61Q9ERF3 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Wdr61Q9ERF3 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Wdr61Q9ERF3 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Wdr61Q9ERF3 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Wdr61Q9ERF3 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Wdr61Q9ERF3 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Wdr61Q9ERF3 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Wdr61Q9ERF3 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Wdr61Q9ERF3 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Wdr61Q9ERF3 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Wdr61Q9ERF3 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Wdr61Q9ERF3 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Wdr61Q9ERF3 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Wdr61Q9ERF3 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Wdr61Q9ERF3 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Wdr61Q9ERF3 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Wdr61Q9ERF3 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Wdr61Q9ERF3 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Wdr61Q9ERF3 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Wdr61Q9ERF3 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms