Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCR2

Ap3s1, AP-3 complex subunit sigma-1, mousemouse

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap3s1Q9DCR2 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ap3s1Q9DCR2 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ap3s1Q9DCR2 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Ap3s1Q9DCR2 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ap3s1Q9DCR2 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ap3s1Q9DCR2 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ap3s1Q9DCR2 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ap3s1Q9DCR2 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ap3s1Q9DCR2 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ap3s1Q9DCR2 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ap3s1Q9DCR2 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Ap3s1Q9DCR2 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Ap3s1Q9DCR2 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ap3s1Q9DCR2 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ap3s1Q9DCR2 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ap3s1Q9DCR2 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ap3s1Q9DCR2 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ap3s1Q9DCR2 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ap3s1Q9DCR2 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ap3s1Q9DCR2 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ap3s1Q9DCR2 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ap3s1Q9DCR2 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ap3s1Q9DCR2 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ap3s1Q9DCR2 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ap3s1Q9DCR2 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ap3s1Q9DCR2 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ap3s1Q9DCR2 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ap3s1Q9DCR2 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ap3s1Q9DCR2 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ap3s1Q9DCR2 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ap3s1Q9DCR2 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ap3s1Q9DCR2 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ap3s1Q9DCR2 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ap3s1Q9DCR2 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ap3s1Q9DCR2 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ap3s1Q9DCR2 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Ap3s1Q9DCR2 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ap3s1Q9DCR2 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ap3s1Q9DCR2 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ap3s1Q9DCR2 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ap3s1Q9DCR2 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ap3s1Q9DCR2 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ap3s1Q9DCR2 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ap3s1Q9DCR2 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ap3s1Q9DCR2 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ap3s1Q9DCR2 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Ap3s1Q9DCR2 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ap3s1Q9DCR2 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ap3s1Q9DCR2 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ap3s1Q9DCR2 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ap3s1Q9DCR2 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ap3s1Q9DCR2 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ap3s1Q9DCR2 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ap3s1Q9DCR2 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ap3s1Q9DCR2 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ap3s1Q9DCR2 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ap3s1Q9DCR2 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ap3s1Q9DCR2 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ap3s1Q9DCR2 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ap3s1Q9DCR2 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ap3s1Q9DCR2 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ap3s1Q9DCR2 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ap3s1Q9DCR2 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ap3s1Q9DCR2 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ap3s1Q9DCR2 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ap3s1Q9DCR2 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ap3s1Q9DCR2 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ap3s1Q9DCR2 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ap3s1Q9DCR2 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ap3s1Q9DCR2 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ap3s1Q9DCR2 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ap3s1Q9DCR2 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ap3s1Q9DCR2 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ap3s1Q9DCR2 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ap3s1Q9DCR2 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ap3s1Q9DCR2 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ap3s1Q9DCR2 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ap3s1Q9DCR2 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ap3s1Q9DCR2 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ap3s1Q9DCR2 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ap3s1Q9DCR2 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Ap3s1Q9DCR2 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ap3s1Q9DCR2 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ap3s1Q9DCR2 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ap3s1Q9DCR2 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ap3s1Q9DCR2 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ap3s1Q9DCR2 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ap3s1Q9DCR2 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ap3s1Q9DCR2 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ap3s1Q9DCR2 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ap3s1Q9DCR2 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ap3s1Q9DCR2 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ap3s1Q9DCR2 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ap3s1Q9DCR2 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ap3s1Q9DCR2 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ap3s1Q9DCR2 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ap3s1Q9DCR2 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ap3s1Q9DCR2 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ap3s1Q9DCR2 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ap3s1Q9DCR2 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.1 ms