Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8C6

Med11, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 11, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med11Q9D8C6 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Med11Q9D8C6 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Med11Q9D8C6 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Med11Q9D8C6 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Med11Q9D8C6 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Med11Q9D8C6 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Med11Q9D8C6 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Med11Q9D8C6 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Med11Q9D8C6 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Med11Q9D8C6 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Med11Q9D8C6 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Med11Q9D8C6 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Med11Q9D8C6 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Med11Q9D8C6 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Med11Q9D8C6 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Med11Q9D8C6 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Med11Q9D8C6 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Med11Q9D8C6 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Med11Q9D8C6 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Med11Q9D8C6 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Med11Q9D8C6 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Med11Q9D8C6 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Med11Q9D8C6 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Med11Q9D8C6 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Med11Q9D8C6 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Med11Q9D8C6 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Med11Q9D8C6 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Med11Q9D8C6 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Med11Q9D8C6 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Med11Q9D8C6 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Med11Q9D8C6 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Med11Q9D8C6 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Med11Q9D8C6 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Med11Q9D8C6 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Med11Q9D8C6 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Med11Q9D8C6 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Med11Q9D8C6 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Med11Q9D8C6 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Med11Q9D8C6 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Med11Q9D8C6 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Med11Q9D8C6 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Med11Q9D8C6 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Med11Q9D8C6 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Med11Q9D8C6 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Med11Q9D8C6 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Med11Q9D8C6 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Med11Q9D8C6 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Med11Q9D8C6 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Med11Q9D8C6 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Med11Q9D8C6 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Med11Q9D8C6 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Med11Q9D8C6 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Med11Q9D8C6 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Med11Q9D8C6 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Med11Q9D8C6 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Med11Q9D8C6 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Med11Q9D8C6 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Med11Q9D8C6 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Med11Q9D8C6 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Med11Q9D8C6 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Med11Q9D8C6 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Med11Q9D8C6 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Med11Q9D8C6 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Med11Q9D8C6 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Med11Q9D8C6 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Med11Q9D8C6 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Med11Q9D8C6 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Med11Q9D8C6 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Med11Q9D8C6 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Med11Q9D8C6 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Med11Q9D8C6 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Med11Q9D8C6 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Med11Q9D8C6 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Med11Q9D8C6 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Med11Q9D8C6 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Med11Q9D8C6 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Med11Q9D8C6 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Med11Q9D8C6 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Med11Q9D8C6 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Med11Q9D8C6 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Med11Q9D8C6 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Med11Q9D8C6 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Med11Q9D8C6 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Med11Q9D8C6 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Med11Q9D8C6 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Med11Q9D8C6 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Med11Q9D8C6 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Med11Q9D8C6 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Med11Q9D8C6 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Med11Q9D8C6 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Med11Q9D8C6 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Med11Q9D8C6 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Med11Q9D8C6 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Med11Q9D8C6 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Med11Q9D8C6 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Med11Q9D8C6 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Med11Q9D8C6 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Med11Q9D8C6 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Med11Q9D8C6 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Med11Q9D8C6 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms