Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Y4

Borcs8, BLOC-1-related complex subunit 8, mousemouse

Predictions only

Length 120 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Borcs8Q9D6Y4 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Borcs8Q9D6Y4 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Borcs8Q9D6Y4 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Borcs8Q9D6Y4 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Borcs8Q9D6Y4 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Borcs8Q9D6Y4 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Borcs8Q9D6Y4 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Borcs8Q9D6Y4 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Borcs8Q9D6Y4 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Borcs8Q9D6Y4 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
Borcs8Q9D6Y4 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Borcs8Q9D6Y4 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Borcs8Q9D6Y4 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Borcs8Q9D6Y4 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Borcs8Q9D6Y4 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Borcs8Q9D6Y4 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Borcs8Q9D6Y4 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Borcs8Q9D6Y4 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Borcs8Q9D6Y4 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Borcs8Q9D6Y4 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Borcs8Q9D6Y4 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Borcs8Q9D6Y4 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Borcs8Q9D6Y4 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Borcs8Q9D6Y4 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Borcs8Q9D6Y4 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Borcs8Q9D6Y4 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Borcs8Q9D6Y4 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Borcs8Q9D6Y4 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Borcs8Q9D6Y4 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Borcs8Q9D6Y4 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Borcs8Q9D6Y4 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Borcs8Q9D6Y4 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Borcs8Q9D6Y4 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Borcs8Q9D6Y4 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Borcs8Q9D6Y4 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Borcs8Q9D6Y4 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Borcs8Q9D6Y4 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Borcs8Q9D6Y4 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Borcs8Q9D6Y4 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Borcs8Q9D6Y4 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Borcs8Q9D6Y4 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Borcs8Q9D6Y4 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Borcs8Q9D6Y4 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Borcs8Q9D6Y4 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Borcs8Q9D6Y4 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Borcs8Q9D6Y4 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Borcs8Q9D6Y4 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Borcs8Q9D6Y4 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Borcs8Q9D6Y4 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Borcs8Q9D6Y4 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Borcs8Q9D6Y4 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Borcs8Q9D6Y4 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Borcs8Q9D6Y4 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Borcs8Q9D6Y4 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Borcs8Q9D6Y4 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Borcs8Q9D6Y4 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Borcs8Q9D6Y4 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Borcs8Q9D6Y4 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Borcs8Q9D6Y4 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Borcs8Q9D6Y4 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Borcs8Q9D6Y4 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Borcs8Q9D6Y4 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Borcs8Q9D6Y4 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Borcs8Q9D6Y4 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Borcs8Q9D6Y4 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Borcs8Q9D6Y4 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Borcs8Q9D6Y4 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Borcs8Q9D6Y4 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Borcs8Q9D6Y4 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Borcs8Q9D6Y4 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Borcs8Q9D6Y4 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Borcs8Q9D6Y4 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Borcs8Q9D6Y4 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Borcs8Q9D6Y4 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Borcs8Q9D6Y4 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Borcs8Q9D6Y4 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Borcs8Q9D6Y4 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Borcs8Q9D6Y4 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Borcs8Q9D6Y4 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Borcs8Q9D6Y4 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Borcs8Q9D6Y4 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Borcs8Q9D6Y4 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Borcs8Q9D6Y4 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Borcs8Q9D6Y4 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Borcs8Q9D6Y4 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Borcs8Q9D6Y4 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Borcs8Q9D6Y4 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Borcs8Q9D6Y4 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Borcs8Q9D6Y4 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Borcs8Q9D6Y4 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Borcs8Q9D6Y4 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Borcs8Q9D6Y4 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Borcs8Q9D6Y4 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Borcs8Q9D6Y4 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Borcs8Q9D6Y4 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Borcs8Q9D6Y4 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Borcs8Q9D6Y4 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Borcs8Q9D6Y4 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Borcs8Q9D6Y4 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Borcs8Q9D6Y4 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms