Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5Y1

Ccdc39, Coiled-coil domain-containing protein 39, mousemouse

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Length 937 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc39Q9D5Y1 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc39Q9D5Y1 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc39Q9D5Y1 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc39Q9D5Y1 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc39Q9D5Y1 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc39Q9D5Y1 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc39Q9D5Y1 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc39Q9D5Y1 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc39Q9D5Y1 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc39Q9D5Y1 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc39Q9D5Y1 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc39Q9D5Y1 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc39Q9D5Y1 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc39Q9D5Y1 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccdc39Q9D5Y1 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccdc39Q9D5Y1 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccdc39Q9D5Y1 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccdc39Q9D5Y1 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccdc39Q9D5Y1 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccdc39Q9D5Y1 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccdc39Q9D5Y1 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccdc39Q9D5Y1 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ccdc39Q9D5Y1 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc39Q9D5Y1 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc39Q9D5Y1 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc39Q9D5Y1 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc39Q9D5Y1 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc39Q9D5Y1 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc39Q9D5Y1 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc39Q9D5Y1 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc39Q9D5Y1 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc39Q9D5Y1 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc39Q9D5Y1 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc39Q9D5Y1 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc39Q9D5Y1 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc39Q9D5Y1 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc39Q9D5Y1 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc39Q9D5Y1 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc39Q9D5Y1 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc39Q9D5Y1 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc39Q9D5Y1 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc39Q9D5Y1 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc39Q9D5Y1 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc39Q9D5Y1 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc39Q9D5Y1 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc39Q9D5Y1 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc39Q9D5Y1 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc39Q9D5Y1 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc39Q9D5Y1 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc39Q9D5Y1 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc39Q9D5Y1 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc39Q9D5Y1 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc39Q9D5Y1 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc39Q9D5Y1 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc39Q9D5Y1 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc39Q9D5Y1 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc39Q9D5Y1 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc39Q9D5Y1 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc39Q9D5Y1 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc39Q9D5Y1 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc39Q9D5Y1 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc39Q9D5Y1 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc39Q9D5Y1 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc39Q9D5Y1 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc39Q9D5Y1 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc39Q9D5Y1 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc39Q9D5Y1 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc39Q9D5Y1 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc39Q9D5Y1 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
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Ccdc39Q9D5Y1 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc39Q9D5Y1 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc39Q9D5Y1 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc39Q9D5Y1 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc39Q9D5Y1 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc39Q9D5Y1 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc39Q9D5Y1 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc39Q9D5Y1 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc39Q9D5Y1 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc39Q9D5Y1 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Ccdc39Q9D5Y1 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Ccdc39Q9D5Y1 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Ccdc39Q9D5Y1 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc39Q9D5Y1 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc39Q9D5Y1 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc39Q9D5Y1 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc39Q9D5Y1 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc39Q9D5Y1 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc39Q9D5Y1 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc39Q9D5Y1 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc39Q9D5Y1 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc39Q9D5Y1 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc39Q9D5Y1 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc39Q9D5Y1 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc39Q9D5Y1 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc39Q9D5Y1 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc39Q9D5Y1 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc39Q9D5Y1 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc39Q9D5Y1 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc39Q9D5Y1 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
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