Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY94

Gins3, DNA replication complex GINS protein PSF3, mousemouse

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Length 216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gins3Q9CY94 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gins3Q9CY94 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gins3Q9CY94 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gins3Q9CY94 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gins3Q9CY94 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gins3Q9CY94 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gins3Q9CY94 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gins3Q9CY94 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gins3Q9CY94 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gins3Q9CY94 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gins3Q9CY94 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Gins3Q9CY94 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gins3Q9CY94 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gins3Q9CY94 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gins3Q9CY94 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gins3Q9CY94 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gins3Q9CY94 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gins3Q9CY94 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gins3Q9CY94 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gins3Q9CY94 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gins3Q9CY94 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gins3Q9CY94 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gins3Q9CY94 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gins3Q9CY94 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gins3Q9CY94 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gins3Q9CY94 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gins3Q9CY94 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gins3Q9CY94 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Gins3Q9CY94 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gins3Q9CY94 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gins3Q9CY94 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gins3Q9CY94 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gins3Q9CY94 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gins3Q9CY94 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gins3Q9CY94 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Gins3Q9CY94 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gins3Q9CY94 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gins3Q9CY94 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gins3Q9CY94 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gins3Q9CY94 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gins3Q9CY94 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gins3Q9CY94 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gins3Q9CY94 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Gins3Q9CY94 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gins3Q9CY94 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gins3Q9CY94 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gins3Q9CY94 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gins3Q9CY94 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gins3Q9CY94 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gins3Q9CY94 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gins3Q9CY94 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gins3Q9CY94 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gins3Q9CY94 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gins3Q9CY94 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gins3Q9CY94 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gins3Q9CY94 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gins3Q9CY94 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gins3Q9CY94 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gins3Q9CY94 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Gins3Q9CY94 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gins3Q9CY94 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gins3Q9CY94 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gins3Q9CY94 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gins3Q9CY94 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gins3Q9CY94 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gins3Q9CY94 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gins3Q9CY94 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gins3Q9CY94 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gins3Q9CY94 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gins3Q9CY94 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Gins3Q9CY94 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gins3Q9CY94 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gins3Q9CY94 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gins3Q9CY94 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gins3Q9CY94 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gins3Q9CY94 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gins3Q9CY94 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Gins3Q9CY94 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gins3Q9CY94 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gins3Q9CY94 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gins3Q9CY94 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gins3Q9CY94 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gins3Q9CY94 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gins3Q9CY94 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gins3Q9CY94 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gins3Q9CY94 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gins3Q9CY94 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gins3Q9CY94 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gins3Q9CY94 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gins3Q9CY94 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gins3Q9CY94 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gins3Q9CY94 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gins3Q9CY94 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gins3Q9CY94 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gins3Q9CY94 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gins3Q9CY94 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gins3Q9CY94 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gins3Q9CY94 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gins3Q9CY94 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gins3Q9CY94 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms