Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXE7

Tmed5, Transmembrane emp24 domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed5Q9CXE7 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tmed5Q9CXE7 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tmed5Q9CXE7 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tmed5Q9CXE7 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tmed5Q9CXE7 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tmed5Q9CXE7 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tmed5Q9CXE7 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Tmed5Q9CXE7 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tmed5Q9CXE7 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tmed5Q9CXE7 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tmed5Q9CXE7 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tmed5Q9CXE7 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tmed5Q9CXE7 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tmed5Q9CXE7 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tmed5Q9CXE7 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tmed5Q9CXE7 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tmed5Q9CXE7 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tmed5Q9CXE7 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tmed5Q9CXE7 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tmed5Q9CXE7 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tmed5Q9CXE7 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tmed5Q9CXE7 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tmed5Q9CXE7 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tmed5Q9CXE7 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tmed5Q9CXE7 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tmed5Q9CXE7 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tmed5Q9CXE7 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tmed5Q9CXE7 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tmed5Q9CXE7 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tmed5Q9CXE7 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Tmed5Q9CXE7 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tmed5Q9CXE7 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tmed5Q9CXE7 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tmed5Q9CXE7 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tmed5Q9CXE7 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tmed5Q9CXE7 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tmed5Q9CXE7 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Tmed5Q9CXE7 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tmed5Q9CXE7 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tmed5Q9CXE7 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tmed5Q9CXE7 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tmed5Q9CXE7 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tmed5Q9CXE7 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tmed5Q9CXE7 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tmed5Q9CXE7 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tmed5Q9CXE7 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tmed5Q9CXE7 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tmed5Q9CXE7 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tmed5Q9CXE7 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Tmed5Q9CXE7 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tmed5Q9CXE7 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tmed5Q9CXE7 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tmed5Q9CXE7 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tmed5Q9CXE7 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tmed5Q9CXE7 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tmed5Q9CXE7 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tmed5Q9CXE7 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tmed5Q9CXE7 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tmed5Q9CXE7 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tmed5Q9CXE7 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tmed5Q9CXE7 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tmed5Q9CXE7 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tmed5Q9CXE7 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tmed5Q9CXE7 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tmed5Q9CXE7 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tmed5Q9CXE7 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tmed5Q9CXE7 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tmed5Q9CXE7 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tmed5Q9CXE7 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tmed5Q9CXE7 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tmed5Q9CXE7 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tmed5Q9CXE7 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tmed5Q9CXE7 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tmed5Q9CXE7 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tmed5Q9CXE7 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tmed5Q9CXE7 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tmed5Q9CXE7 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tmed5Q9CXE7 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tmed5Q9CXE7 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tmed5Q9CXE7 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tmed5Q9CXE7 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tmed5Q9CXE7 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tmed5Q9CXE7 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tmed5Q9CXE7 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tmed5Q9CXE7 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tmed5Q9CXE7 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tmed5Q9CXE7 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tmed5Q9CXE7 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tmed5Q9CXE7 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tmed5Q9CXE7 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tmed5Q9CXE7 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tmed5Q9CXE7 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tmed5Q9CXE7 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tmed5Q9CXE7 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tmed5Q9CXE7 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Tmed5Q9CXE7 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tmed5Q9CXE7 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tmed5Q9CXE7 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tmed5Q9CXE7 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tmed5Q9CXE7 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.1 ms