Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQQ7

Atp5f1, ATP synthase F(0) complex subunit B1, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp5f1Q9CQQ7 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Atp5f1Q9CQQ7 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Atp5f1Q9CQQ7 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Atp5f1Q9CQQ7 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Atp5f1Q9CQQ7 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Atp5f1Q9CQQ7 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Atp5f1Q9CQQ7 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Atp5f1Q9CQQ7 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Atp5f1Q9CQQ7 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Atp5f1Q9CQQ7 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Atp5f1Q9CQQ7 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Atp5f1Q9CQQ7 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Atp5f1Q9CQQ7 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Atp5f1Q9CQQ7 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Atp5f1Q9CQQ7 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Atp5f1Q9CQQ7 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Atp5f1Q9CQQ7 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Atp5f1Q9CQQ7 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Atp5f1Q9CQQ7 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Atp5f1Q9CQQ7 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Atp5f1Q9CQQ7 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Atp5f1Q9CQQ7 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Atp5f1Q9CQQ7 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Atp5f1Q9CQQ7 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Atp5f1Q9CQQ7 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Atp5f1Q9CQQ7 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Atp5f1Q9CQQ7 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Atp5f1Q9CQQ7 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Atp5f1Q9CQQ7 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Atp5f1Q9CQQ7 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Atp5f1Q9CQQ7 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Atp5f1Q9CQQ7 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Atp5f1Q9CQQ7 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atp5f1Q9CQQ7 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atp5f1Q9CQQ7 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atp5f1Q9CQQ7 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atp5f1Q9CQQ7 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atp5f1Q9CQQ7 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atp5f1Q9CQQ7 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atp5f1Q9CQQ7 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atp5f1Q9CQQ7 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atp5f1Q9CQQ7 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atp5f1Q9CQQ7 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atp5f1Q9CQQ7 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atp5f1Q9CQQ7 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atp5f1Q9CQQ7 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atp5f1Q9CQQ7 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Atp5f1Q9CQQ7 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atp5f1Q9CQQ7 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Atp5f1Q9CQQ7 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Atp5f1Q9CQQ7 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Atp5f1Q9CQQ7 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Atp5f1Q9CQQ7 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Atp5f1Q9CQQ7 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Atp5f1Q9CQQ7 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Atp5f1Q9CQQ7 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Atp5f1Q9CQQ7 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Atp5f1Q9CQQ7 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Atp5f1Q9CQQ7 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Atp5f1Q9CQQ7 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Atp5f1Q9CQQ7 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Atp5f1Q9CQQ7 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Atp5f1Q9CQQ7 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atp5f1Q9CQQ7 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atp5f1Q9CQQ7 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atp5f1Q9CQQ7 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atp5f1Q9CQQ7 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atp5f1Q9CQQ7 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atp5f1Q9CQQ7 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atp5f1Q9CQQ7 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atp5f1Q9CQQ7 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atp5f1Q9CQQ7 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atp5f1Q9CQQ7 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atp5f1Q9CQQ7 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atp5f1Q9CQQ7 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atp5f1Q9CQQ7 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atp5f1Q9CQQ7 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atp5f1Q9CQQ7 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atp5f1Q9CQQ7 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atp5f1Q9CQQ7 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atp5f1Q9CQQ7 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atp5f1Q9CQQ7 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atp5f1Q9CQQ7 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atp5f1Q9CQQ7 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atp5f1Q9CQQ7 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atp5f1Q9CQQ7 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atp5f1Q9CQQ7 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atp5f1Q9CQQ7 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atp5f1Q9CQQ7 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atp5f1Q9CQQ7 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Atp5f1Q9CQQ7 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atp5f1Q9CQQ7 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atp5f1Q9CQQ7 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atp5f1Q9CQQ7 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atp5f1Q9CQQ7 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Atp5f1Q9CQQ7 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atp5f1Q9CQQ7 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atp5f1Q9CQQ7 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atp5f1Q9CQQ7 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atp5f1Q9CQQ7 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms