Protein–RNA interactions for Protein: Q9BT76

UPK3B, Uroplakin-3b, humanhuman

Predictions only

Length 320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPK3BQ9BT76 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
UPK3BQ9BT76 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
UPK3BQ9BT76 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
UPK3BQ9BT76 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
UPK3BQ9BT76 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC14.57□□□□□ -0.08
UPK3BQ9BT76 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
UPK3BQ9BT76 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
UPK3BQ9BT76 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
UPK3BQ9BT76 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
UPK3BQ9BT76 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
UPK3BQ9BT76 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
UPK3BQ9BT76 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
UPK3BQ9BT76 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
UPK3BQ9BT76 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
UPK3BQ9BT76 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
UPK3BQ9BT76 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
UPK3BQ9BT76 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
UPK3BQ9BT76 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
UPK3BQ9BT76 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
UPK3BQ9BT76 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
UPK3BQ9BT76 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
UPK3BQ9BT76 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
UPK3BQ9BT76 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
UPK3BQ9BT76 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
UPK3BQ9BT76 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
UPK3BQ9BT76 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
UPK3BQ9BT76 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
UPK3BQ9BT76 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
UPK3BQ9BT76 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
UPK3BQ9BT76 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
UPK3BQ9BT76 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
UPK3BQ9BT76 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
UPK3BQ9BT76 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
UPK3BQ9BT76 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
UPK3BQ9BT76 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
UPK3BQ9BT76 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
UPK3BQ9BT76 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
UPK3BQ9BT76 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
UPK3BQ9BT76 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
UPK3BQ9BT76 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
UPK3BQ9BT76 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC14.56□□□□□ -0.08
UPK3BQ9BT76 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
UPK3BQ9BT76 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
UPK3BQ9BT76 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
UPK3BQ9BT76 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
UPK3BQ9BT76 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
UPK3BQ9BT76 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
UPK3BQ9BT76 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
UPK3BQ9BT76 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
UPK3BQ9BT76 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
UPK3BQ9BT76 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
UPK3BQ9BT76 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
UPK3BQ9BT76 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
UPK3BQ9BT76 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
UPK3BQ9BT76 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
UPK3BQ9BT76 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
UPK3BQ9BT76 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
UPK3BQ9BT76 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
UPK3BQ9BT76 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
UPK3BQ9BT76 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
UPK3BQ9BT76 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
UPK3BQ9BT76 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
UPK3BQ9BT76 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
UPK3BQ9BT76 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
UPK3BQ9BT76 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
UPK3BQ9BT76 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
UPK3BQ9BT76 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
UPK3BQ9BT76 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
UPK3BQ9BT76 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
UPK3BQ9BT76 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
UPK3BQ9BT76 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
UPK3BQ9BT76 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
UPK3BQ9BT76 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
UPK3BQ9BT76 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
UPK3BQ9BT76 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
UPK3BQ9BT76 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
UPK3BQ9BT76 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
UPK3BQ9BT76 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
UPK3BQ9BT76 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
UPK3BQ9BT76 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
UPK3BQ9BT76 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
UPK3BQ9BT76 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
UPK3BQ9BT76 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
UPK3BQ9BT76 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
UPK3BQ9BT76 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
UPK3BQ9BT76 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
UPK3BQ9BT76 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
UPK3BQ9BT76 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
UPK3BQ9BT76 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
UPK3BQ9BT76 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
UPK3BQ9BT76 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
UPK3BQ9BT76 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
UPK3BQ9BT76 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
UPK3BQ9BT76 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
UPK3BQ9BT76 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
UPK3BQ9BT76 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
UPK3BQ9BT76 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
UPK3BQ9BT76 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
UPK3BQ9BT76 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
UPK3BQ9BT76 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms