Protein–RNA interactions for Protein: Q8ND90

PNMA1, Paraneoplastic antigen Ma1, humanhuman

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNMA1Q8ND90 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PNMA1Q8ND90 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PNMA1Q8ND90 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PNMA1Q8ND90 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PNMA1Q8ND90 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PNMA1Q8ND90 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PNMA1Q8ND90 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PNMA1Q8ND90 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PNMA1Q8ND90 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PNMA1Q8ND90 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PNMA1Q8ND90 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PNMA1Q8ND90 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PNMA1Q8ND90 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PNMA1Q8ND90 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PNMA1Q8ND90 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PNMA1Q8ND90 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PNMA1Q8ND90 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PNMA1Q8ND90 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PNMA1Q8ND90 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PNMA1Q8ND90 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PNMA1Q8ND90 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PNMA1Q8ND90 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PNMA1Q8ND90 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PNMA1Q8ND90 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PNMA1Q8ND90 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PNMA1Q8ND90 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PNMA1Q8ND90 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PNMA1Q8ND90 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PNMA1Q8ND90 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PNMA1Q8ND90 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PNMA1Q8ND90 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PNMA1Q8ND90 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PNMA1Q8ND90 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PNMA1Q8ND90 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PNMA1Q8ND90 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PNMA1Q8ND90 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PNMA1Q8ND90 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PNMA1Q8ND90 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PNMA1Q8ND90 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PNMA1Q8ND90 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PNMA1Q8ND90 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PNMA1Q8ND90 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
PNMA1Q8ND90 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PNMA1Q8ND90 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PNMA1Q8ND90 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PNMA1Q8ND90 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PNMA1Q8ND90 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PNMA1Q8ND90 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PNMA1Q8ND90 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PNMA1Q8ND90 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PNMA1Q8ND90 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PNMA1Q8ND90 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PNMA1Q8ND90 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PNMA1Q8ND90 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
PNMA1Q8ND90 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PNMA1Q8ND90 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PNMA1Q8ND90 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PNMA1Q8ND90 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PNMA1Q8ND90 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PNMA1Q8ND90 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PNMA1Q8ND90 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PNMA1Q8ND90 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PNMA1Q8ND90 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PNMA1Q8ND90 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PNMA1Q8ND90 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PNMA1Q8ND90 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PNMA1Q8ND90 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PNMA1Q8ND90 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PNMA1Q8ND90 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PNMA1Q8ND90 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PNMA1Q8ND90 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
PNMA1Q8ND90 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PNMA1Q8ND90 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PNMA1Q8ND90 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PNMA1Q8ND90 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PNMA1Q8ND90 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PNMA1Q8ND90 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PNMA1Q8ND90 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PNMA1Q8ND90 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PNMA1Q8ND90 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PNMA1Q8ND90 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PNMA1Q8ND90 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PNMA1Q8ND90 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PNMA1Q8ND90 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PNMA1Q8ND90 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PNMA1Q8ND90 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PNMA1Q8ND90 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PNMA1Q8ND90 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PNMA1Q8ND90 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PNMA1Q8ND90 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PNMA1Q8ND90 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PNMA1Q8ND90 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PNMA1Q8ND90 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PNMA1Q8ND90 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PNMA1Q8ND90 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PNMA1Q8ND90 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PNMA1Q8ND90 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PNMA1Q8ND90 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PNMA1Q8ND90 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PNMA1Q8ND90 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms