Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2Z2

Prpf39, Pre-mRNA-processing factor 39, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf39Q8K2Z2 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Prpf39Q8K2Z2 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Prpf39Q8K2Z2 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Prpf39Q8K2Z2 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Prpf39Q8K2Z2 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Prpf39Q8K2Z2 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Prpf39Q8K2Z2 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Prpf39Q8K2Z2 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Prpf39Q8K2Z2 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Prpf39Q8K2Z2 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Prpf39Q8K2Z2 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Prpf39Q8K2Z2 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Prpf39Q8K2Z2 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Prpf39Q8K2Z2 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Prpf39Q8K2Z2 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Prpf39Q8K2Z2 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Prpf39Q8K2Z2 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Prpf39Q8K2Z2 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Prpf39Q8K2Z2 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Prpf39Q8K2Z2 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Prpf39Q8K2Z2 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Prpf39Q8K2Z2 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Prpf39Q8K2Z2 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Prpf39Q8K2Z2 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Prpf39Q8K2Z2 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Prpf39Q8K2Z2 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Prpf39Q8K2Z2 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Prpf39Q8K2Z2 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Prpf39Q8K2Z2 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Prpf39Q8K2Z2 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Prpf39Q8K2Z2 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Prpf39Q8K2Z2 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Prpf39Q8K2Z2 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Prpf39Q8K2Z2 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Prpf39Q8K2Z2 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Prpf39Q8K2Z2 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Prpf39Q8K2Z2 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Prpf39Q8K2Z2 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Prpf39Q8K2Z2 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Prpf39Q8K2Z2 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Prpf39Q8K2Z2 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Prpf39Q8K2Z2 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Prpf39Q8K2Z2 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Prpf39Q8K2Z2 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Prpf39Q8K2Z2 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Prpf39Q8K2Z2 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Prpf39Q8K2Z2 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Prpf39Q8K2Z2 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Prpf39Q8K2Z2 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Prpf39Q8K2Z2 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Prpf39Q8K2Z2 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Prpf39Q8K2Z2 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Prpf39Q8K2Z2 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Prpf39Q8K2Z2 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Prpf39Q8K2Z2 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Prpf39Q8K2Z2 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Prpf39Q8K2Z2 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Prpf39Q8K2Z2 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Prpf39Q8K2Z2 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Prpf39Q8K2Z2 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Prpf39Q8K2Z2 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Prpf39Q8K2Z2 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Prpf39Q8K2Z2 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Prpf39Q8K2Z2 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Prpf39Q8K2Z2 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Prpf39Q8K2Z2 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Prpf39Q8K2Z2 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Prpf39Q8K2Z2 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Prpf39Q8K2Z2 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Prpf39Q8K2Z2 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Prpf39Q8K2Z2 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Prpf39Q8K2Z2 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Prpf39Q8K2Z2 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Prpf39Q8K2Z2 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Prpf39Q8K2Z2 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Prpf39Q8K2Z2 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Prpf39Q8K2Z2 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Prpf39Q8K2Z2 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Prpf39Q8K2Z2 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Prpf39Q8K2Z2 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Prpf39Q8K2Z2 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Prpf39Q8K2Z2 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Prpf39Q8K2Z2 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Prpf39Q8K2Z2 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Prpf39Q8K2Z2 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Prpf39Q8K2Z2 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Prpf39Q8K2Z2 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Prpf39Q8K2Z2 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Prpf39Q8K2Z2 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Prpf39Q8K2Z2 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Prpf39Q8K2Z2 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Prpf39Q8K2Z2 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Prpf39Q8K2Z2 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Prpf39Q8K2Z2 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Prpf39Q8K2Z2 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Prpf39Q8K2Z2 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Prpf39Q8K2Z2 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Prpf39Q8K2Z2 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Prpf39Q8K2Z2 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Prpf39Q8K2Z2 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms