Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWT1

SCN4B, Sodium channel subunit beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN4BQ8IWT1 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SCN4BQ8IWT1 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
SCN4BQ8IWT1 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
SCN4BQ8IWT1 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
SCN4BQ8IWT1 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
SCN4BQ8IWT1 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
SCN4BQ8IWT1 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
SCN4BQ8IWT1 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SCN4BQ8IWT1 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SCN4BQ8IWT1 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SCN4BQ8IWT1 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SCN4BQ8IWT1 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SCN4BQ8IWT1 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SCN4BQ8IWT1 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SCN4BQ8IWT1 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SCN4BQ8IWT1 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SCN4BQ8IWT1 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SCN4BQ8IWT1 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SCN4BQ8IWT1 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SCN4BQ8IWT1 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SCN4BQ8IWT1 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SCN4BQ8IWT1 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SCN4BQ8IWT1 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SCN4BQ8IWT1 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SCN4BQ8IWT1 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SCN4BQ8IWT1 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SCN4BQ8IWT1 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SCN4BQ8IWT1 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SCN4BQ8IWT1 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SCN4BQ8IWT1 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SCN4BQ8IWT1 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SCN4BQ8IWT1 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SCN4BQ8IWT1 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SCN4BQ8IWT1 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SCN4BQ8IWT1 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SCN4BQ8IWT1 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SCN4BQ8IWT1 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SCN4BQ8IWT1 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SCN4BQ8IWT1 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SCN4BQ8IWT1 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SCN4BQ8IWT1 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SCN4BQ8IWT1 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SCN4BQ8IWT1 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SCN4BQ8IWT1 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SCN4BQ8IWT1 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SCN4BQ8IWT1 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SCN4BQ8IWT1 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SCN4BQ8IWT1 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SCN4BQ8IWT1 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SCN4BQ8IWT1 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SCN4BQ8IWT1 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SCN4BQ8IWT1 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SCN4BQ8IWT1 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SCN4BQ8IWT1 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SCN4BQ8IWT1 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SCN4BQ8IWT1 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SCN4BQ8IWT1 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SCN4BQ8IWT1 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SCN4BQ8IWT1 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SCN4BQ8IWT1 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SCN4BQ8IWT1 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SCN4BQ8IWT1 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SCN4BQ8IWT1 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SCN4BQ8IWT1 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SCN4BQ8IWT1 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SCN4BQ8IWT1 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SCN4BQ8IWT1 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SCN4BQ8IWT1 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SCN4BQ8IWT1 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SCN4BQ8IWT1 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SCN4BQ8IWT1 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SCN4BQ8IWT1 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SCN4BQ8IWT1 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SCN4BQ8IWT1 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SCN4BQ8IWT1 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SCN4BQ8IWT1 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SCN4BQ8IWT1 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SCN4BQ8IWT1 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SCN4BQ8IWT1 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SCN4BQ8IWT1 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SCN4BQ8IWT1 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SCN4BQ8IWT1 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SCN4BQ8IWT1 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SCN4BQ8IWT1 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SCN4BQ8IWT1 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SCN4BQ8IWT1 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SCN4BQ8IWT1 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SCN4BQ8IWT1 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SCN4BQ8IWT1 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SCN4BQ8IWT1 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SCN4BQ8IWT1 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SCN4BQ8IWT1 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SCN4BQ8IWT1 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SCN4BQ8IWT1 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SCN4BQ8IWT1 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SCN4BQ8IWT1 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SCN4BQ8IWT1 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SCN4BQ8IWT1 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SCN4BQ8IWT1 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SCN4BQ8IWT1 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms