Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXL7

Arfrp1, ADP-ribosylation factor-related protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arfrp1Q8BXL7 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Arfrp1Q8BXL7 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Arfrp1Q8BXL7 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Arfrp1Q8BXL7 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Arfrp1Q8BXL7 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Arfrp1Q8BXL7 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Arfrp1Q8BXL7 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Arfrp1Q8BXL7 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Arfrp1Q8BXL7 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Arfrp1Q8BXL7 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Arfrp1Q8BXL7 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Arfrp1Q8BXL7 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Arfrp1Q8BXL7 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Arfrp1Q8BXL7 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Arfrp1Q8BXL7 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Arfrp1Q8BXL7 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Arfrp1Q8BXL7 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Arfrp1Q8BXL7 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Arfrp1Q8BXL7 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Arfrp1Q8BXL7 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Arfrp1Q8BXL7 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Arfrp1Q8BXL7 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Arfrp1Q8BXL7 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Arfrp1Q8BXL7 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Arfrp1Q8BXL7 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Arfrp1Q8BXL7 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Arfrp1Q8BXL7 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Arfrp1Q8BXL7 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Arfrp1Q8BXL7 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Arfrp1Q8BXL7 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Arfrp1Q8BXL7 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Arfrp1Q8BXL7 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Arfrp1Q8BXL7 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Arfrp1Q8BXL7 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Arfrp1Q8BXL7 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Arfrp1Q8BXL7 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Arfrp1Q8BXL7 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Arfrp1Q8BXL7 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Arfrp1Q8BXL7 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Arfrp1Q8BXL7 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Arfrp1Q8BXL7 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Arfrp1Q8BXL7 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Arfrp1Q8BXL7 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Arfrp1Q8BXL7 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Arfrp1Q8BXL7 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Arfrp1Q8BXL7 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Arfrp1Q8BXL7 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Arfrp1Q8BXL7 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Arfrp1Q8BXL7 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Arfrp1Q8BXL7 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Arfrp1Q8BXL7 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Arfrp1Q8BXL7 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Arfrp1Q8BXL7 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Arfrp1Q8BXL7 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Arfrp1Q8BXL7 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Arfrp1Q8BXL7 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Arfrp1Q8BXL7 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Arfrp1Q8BXL7 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Arfrp1Q8BXL7 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Arfrp1Q8BXL7 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Arfrp1Q8BXL7 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Arfrp1Q8BXL7 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Arfrp1Q8BXL7 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Arfrp1Q8BXL7 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Arfrp1Q8BXL7 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Arfrp1Q8BXL7 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Arfrp1Q8BXL7 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Arfrp1Q8BXL7 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Arfrp1Q8BXL7 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Arfrp1Q8BXL7 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Arfrp1Q8BXL7 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Arfrp1Q8BXL7 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Arfrp1Q8BXL7 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Arfrp1Q8BXL7 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Arfrp1Q8BXL7 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Arfrp1Q8BXL7 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Arfrp1Q8BXL7 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Arfrp1Q8BXL7 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Arfrp1Q8BXL7 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Arfrp1Q8BXL7 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Arfrp1Q8BXL7 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Arfrp1Q8BXL7 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Arfrp1Q8BXL7 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Arfrp1Q8BXL7 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Arfrp1Q8BXL7 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Arfrp1Q8BXL7 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Arfrp1Q8BXL7 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Arfrp1Q8BXL7 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Arfrp1Q8BXL7 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Arfrp1Q8BXL7 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Arfrp1Q8BXL7 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Arfrp1Q8BXL7 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Arfrp1Q8BXL7 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Arfrp1Q8BXL7 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Arfrp1Q8BXL7 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Arfrp1Q8BXL7 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Arfrp1Q8BXL7 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Arfrp1Q8BXL7 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Arfrp1Q8BXL7 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Arfrp1Q8BXL7 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.6 ms