Protein–RNA interactions for Protein: Q8BTW3

Exosc6, Exosome complex component MTR3, mousemouse

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Exosc6Q8BTW3 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Exosc6Q8BTW3 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Exosc6Q8BTW3 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Exosc6Q8BTW3 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Exosc6Q8BTW3 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Exosc6Q8BTW3 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Exosc6Q8BTW3 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Exosc6Q8BTW3 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Exosc6Q8BTW3 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Exosc6Q8BTW3 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Exosc6Q8BTW3 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Exosc6Q8BTW3 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Exosc6Q8BTW3 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Exosc6Q8BTW3 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Exosc6Q8BTW3 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Exosc6Q8BTW3 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Exosc6Q8BTW3 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Exosc6Q8BTW3 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Exosc6Q8BTW3 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Exosc6Q8BTW3 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Exosc6Q8BTW3 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Exosc6Q8BTW3 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Exosc6Q8BTW3 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Exosc6Q8BTW3 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Exosc6Q8BTW3 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Exosc6Q8BTW3 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Exosc6Q8BTW3 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Exosc6Q8BTW3 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Exosc6Q8BTW3 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Exosc6Q8BTW3 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Exosc6Q8BTW3 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Exosc6Q8BTW3 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Exosc6Q8BTW3 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Exosc6Q8BTW3 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Exosc6Q8BTW3 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Exosc6Q8BTW3 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Exosc6Q8BTW3 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Exosc6Q8BTW3 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Exosc6Q8BTW3 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Exosc6Q8BTW3 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Exosc6Q8BTW3 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Exosc6Q8BTW3 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Exosc6Q8BTW3 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Exosc6Q8BTW3 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Exosc6Q8BTW3 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Exosc6Q8BTW3 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Exosc6Q8BTW3 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Exosc6Q8BTW3 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Exosc6Q8BTW3 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Exosc6Q8BTW3 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Exosc6Q8BTW3 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Exosc6Q8BTW3 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Exosc6Q8BTW3 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Exosc6Q8BTW3 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Exosc6Q8BTW3 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Exosc6Q8BTW3 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Exosc6Q8BTW3 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Exosc6Q8BTW3 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Exosc6Q8BTW3 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Exosc6Q8BTW3 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Exosc6Q8BTW3 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Exosc6Q8BTW3 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Exosc6Q8BTW3 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Exosc6Q8BTW3 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Exosc6Q8BTW3 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Exosc6Q8BTW3 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Exosc6Q8BTW3 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Exosc6Q8BTW3 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Exosc6Q8BTW3 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Exosc6Q8BTW3 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Exosc6Q8BTW3 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Exosc6Q8BTW3 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Exosc6Q8BTW3 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Exosc6Q8BTW3 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Exosc6Q8BTW3 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Exosc6Q8BTW3 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Exosc6Q8BTW3 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Exosc6Q8BTW3 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Exosc6Q8BTW3 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Exosc6Q8BTW3 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Exosc6Q8BTW3 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Exosc6Q8BTW3 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Exosc6Q8BTW3 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Exosc6Q8BTW3 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Exosc6Q8BTW3 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Exosc6Q8BTW3 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Exosc6Q8BTW3 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Exosc6Q8BTW3 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Exosc6Q8BTW3 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Exosc6Q8BTW3 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Exosc6Q8BTW3 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Exosc6Q8BTW3 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Exosc6Q8BTW3 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Exosc6Q8BTW3 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Exosc6Q8BTW3 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Exosc6Q8BTW3 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Exosc6Q8BTW3 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Exosc6Q8BTW3 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Exosc6Q8BTW3 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Exosc6Q8BTW3 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms