Protein–RNA interactions for Protein: Q78IS1

Tmed3, Transmembrane emp24 domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed3Q78IS1 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmed3Q78IS1 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmed3Q78IS1 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmed3Q78IS1 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmed3Q78IS1 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmed3Q78IS1 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmed3Q78IS1 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmed3Q78IS1 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmed3Q78IS1 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmed3Q78IS1 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmed3Q78IS1 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmed3Q78IS1 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmed3Q78IS1 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmed3Q78IS1 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmed3Q78IS1 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmed3Q78IS1 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmed3Q78IS1 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmed3Q78IS1 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmed3Q78IS1 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmed3Q78IS1 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmed3Q78IS1 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmed3Q78IS1 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmed3Q78IS1 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmed3Q78IS1 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmed3Q78IS1 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tmed3Q78IS1 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tmed3Q78IS1 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tmed3Q78IS1 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Tmed3Q78IS1 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tmed3Q78IS1 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tmed3Q78IS1 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Tmed3Q78IS1 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tmed3Q78IS1 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Tmed3Q78IS1 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tmed3Q78IS1 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tmed3Q78IS1 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tmed3Q78IS1 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tmed3Q78IS1 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tmed3Q78IS1 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tmed3Q78IS1 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmed3Q78IS1 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmed3Q78IS1 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmed3Q78IS1 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmed3Q78IS1 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmed3Q78IS1 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmed3Q78IS1 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmed3Q78IS1 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmed3Q78IS1 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmed3Q78IS1 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmed3Q78IS1 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmed3Q78IS1 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmed3Q78IS1 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmed3Q78IS1 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmed3Q78IS1 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmed3Q78IS1 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmed3Q78IS1 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmed3Q78IS1 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmed3Q78IS1 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmed3Q78IS1 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmed3Q78IS1 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmed3Q78IS1 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmed3Q78IS1 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmed3Q78IS1 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmed3Q78IS1 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmed3Q78IS1 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmed3Q78IS1 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmed3Q78IS1 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmed3Q78IS1 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmed3Q78IS1 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmed3Q78IS1 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmed3Q78IS1 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmed3Q78IS1 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmed3Q78IS1 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmed3Q78IS1 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmed3Q78IS1 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmed3Q78IS1 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmed3Q78IS1 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmed3Q78IS1 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmed3Q78IS1 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmed3Q78IS1 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmed3Q78IS1 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmed3Q78IS1 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmed3Q78IS1 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmed3Q78IS1 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmed3Q78IS1 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmed3Q78IS1 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmed3Q78IS1 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmed3Q78IS1 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmed3Q78IS1 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmed3Q78IS1 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmed3Q78IS1 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmed3Q78IS1 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmed3Q78IS1 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmed3Q78IS1 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmed3Q78IS1 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmed3Q78IS1 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmed3Q78IS1 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmed3Q78IS1 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmed3Q78IS1 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmed3Q78IS1 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms