Protein–RNA interactions for Protein: Q70CQ4

USP31, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 31, humanhuman

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Length 1,352 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP31Q70CQ4 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
USP31Q70CQ4 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC28.42■■■□□ 2.14
USP31Q70CQ4 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
USP31Q70CQ4 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC28.42■■■□□ 2.14
USP31Q70CQ4 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.42■■■□□ 2.14
USP31Q70CQ4 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
USP31Q70CQ4 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
USP31Q70CQ4 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC28.42■■■□□ 2.14
USP31Q70CQ4 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
USP31Q70CQ4 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
USP31Q70CQ4 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
USP31Q70CQ4 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
USP31Q70CQ4 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
USP31Q70CQ4 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
USP31Q70CQ4 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
USP31Q70CQ4 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
USP31Q70CQ4 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
USP31Q70CQ4 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
USP31Q70CQ4 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
USP31Q70CQ4 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
USP31Q70CQ4 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
USP31Q70CQ4 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
USP31Q70CQ4 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
USP31Q70CQ4 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
USP31Q70CQ4 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
USP31Q70CQ4 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
USP31Q70CQ4 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
USP31Q70CQ4 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
USP31Q70CQ4 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
USP31Q70CQ4 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
USP31Q70CQ4 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
USP31Q70CQ4 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
USP31Q70CQ4 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
USP31Q70CQ4 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
USP31Q70CQ4 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
USP31Q70CQ4 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
USP31Q70CQ4 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
USP31Q70CQ4 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
USP31Q70CQ4 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
USP31Q70CQ4 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
USP31Q70CQ4 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
USP31Q70CQ4 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
USP31Q70CQ4 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
USP31Q70CQ4 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
USP31Q70CQ4 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
USP31Q70CQ4 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
USP31Q70CQ4 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
USP31Q70CQ4 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
USP31Q70CQ4 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
USP31Q70CQ4 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
USP31Q70CQ4 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
USP31Q70CQ4 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
USP31Q70CQ4 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
USP31Q70CQ4 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
USP31Q70CQ4 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
USP31Q70CQ4 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
USP31Q70CQ4 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
USP31Q70CQ4 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
USP31Q70CQ4 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
USP31Q70CQ4 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
USP31Q70CQ4 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
USP31Q70CQ4 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
USP31Q70CQ4 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
USP31Q70CQ4 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
USP31Q70CQ4 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
USP31Q70CQ4 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
USP31Q70CQ4 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
USP31Q70CQ4 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
USP31Q70CQ4 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
USP31Q70CQ4 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
USP31Q70CQ4 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
USP31Q70CQ4 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
USP31Q70CQ4 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
USP31Q70CQ4 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
USP31Q70CQ4 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
USP31Q70CQ4 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
USP31Q70CQ4 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
USP31Q70CQ4 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
USP31Q70CQ4 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
USP31Q70CQ4 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
USP31Q70CQ4 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC28.37■■■□□ 2.13
USP31Q70CQ4 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
USP31Q70CQ4 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC28.37■■■□□ 2.13
USP31Q70CQ4 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
USP31Q70CQ4 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
USP31Q70CQ4 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
USP31Q70CQ4 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
USP31Q70CQ4 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
USP31Q70CQ4 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC28.36■■■□□ 2.13
USP31Q70CQ4 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
USP31Q70CQ4 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
USP31Q70CQ4 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
USP31Q70CQ4 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
USP31Q70CQ4 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
USP31Q70CQ4 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
USP31Q70CQ4 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
USP31Q70CQ4 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC28.36■■■□□ 2.13
USP31Q70CQ4 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
USP31Q70CQ4 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
USP31Q70CQ4 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
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