Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWZ2

Ube2r2, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 R2, mousemouse

Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2r2Q6ZWZ2 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ube2r2Q6ZWZ2 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ube2r2Q6ZWZ2 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ube2r2Q6ZWZ2 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ube2r2Q6ZWZ2 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ube2r2Q6ZWZ2 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ube2r2Q6ZWZ2 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Ube2r2Q6ZWZ2 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ube2r2Q6ZWZ2 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ube2r2Q6ZWZ2 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ube2r2Q6ZWZ2 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Ube2r2Q6ZWZ2 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ube2r2Q6ZWZ2 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ube2r2Q6ZWZ2 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ube2r2Q6ZWZ2 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ube2r2Q6ZWZ2 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ube2r2Q6ZWZ2 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ube2r2Q6ZWZ2 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ube2r2Q6ZWZ2 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ube2r2Q6ZWZ2 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ube2r2Q6ZWZ2 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ube2r2Q6ZWZ2 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ube2r2Q6ZWZ2 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ube2r2Q6ZWZ2 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ube2r2Q6ZWZ2 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ube2r2Q6ZWZ2 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ube2r2Q6ZWZ2 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ube2r2Q6ZWZ2 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ube2r2Q6ZWZ2 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ube2r2Q6ZWZ2 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ube2r2Q6ZWZ2 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ube2r2Q6ZWZ2 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ube2r2Q6ZWZ2 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ube2r2Q6ZWZ2 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ube2r2Q6ZWZ2 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ube2r2Q6ZWZ2 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ube2r2Q6ZWZ2 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ube2r2Q6ZWZ2 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ube2r2Q6ZWZ2 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ube2r2Q6ZWZ2 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ube2r2Q6ZWZ2 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ube2r2Q6ZWZ2 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ube2r2Q6ZWZ2 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ube2r2Q6ZWZ2 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ube2r2Q6ZWZ2 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ube2r2Q6ZWZ2 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ube2r2Q6ZWZ2 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Ube2r2Q6ZWZ2 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ube2r2Q6ZWZ2 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ube2r2Q6ZWZ2 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ube2r2Q6ZWZ2 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ube2r2Q6ZWZ2 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ube2r2Q6ZWZ2 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ube2r2Q6ZWZ2 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ube2r2Q6ZWZ2 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ube2r2Q6ZWZ2 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ube2r2Q6ZWZ2 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ube2r2Q6ZWZ2 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ube2r2Q6ZWZ2 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ube2r2Q6ZWZ2 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC18■□□□□ 0.47
Ube2r2Q6ZWZ2 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Ube2r2Q6ZWZ2 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ube2r2Q6ZWZ2 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ube2r2Q6ZWZ2 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ube2r2Q6ZWZ2 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ube2r2Q6ZWZ2 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ube2r2Q6ZWZ2 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ube2r2Q6ZWZ2 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ube2r2Q6ZWZ2 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ube2r2Q6ZWZ2 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ube2r2Q6ZWZ2 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ube2r2Q6ZWZ2 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ube2r2Q6ZWZ2 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ube2r2Q6ZWZ2 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ube2r2Q6ZWZ2 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ube2r2Q6ZWZ2 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ube2r2Q6ZWZ2 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ube2r2Q6ZWZ2 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ube2r2Q6ZWZ2 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ube2r2Q6ZWZ2 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ube2r2Q6ZWZ2 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ube2r2Q6ZWZ2 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ube2r2Q6ZWZ2 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ube2r2Q6ZWZ2 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ube2r2Q6ZWZ2 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ube2r2Q6ZWZ2 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ube2r2Q6ZWZ2 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ube2r2Q6ZWZ2 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ube2r2Q6ZWZ2 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ube2r2Q6ZWZ2 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ube2r2Q6ZWZ2 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ube2r2Q6ZWZ2 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ube2r2Q6ZWZ2 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms