Protein–RNA interactions for Protein: Q6W5C0

Cxcl3, C-X-C motif chemokine 3, mousemouse

Predictions only

Length 100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcl3Q6W5C0 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cxcl3Q6W5C0 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cxcl3Q6W5C0 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cxcl3Q6W5C0 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Cxcl3Q6W5C0 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cxcl3Q6W5C0 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cxcl3Q6W5C0 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cxcl3Q6W5C0 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cxcl3Q6W5C0 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cxcl3Q6W5C0 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cxcl3Q6W5C0 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Cxcl3Q6W5C0 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cxcl3Q6W5C0 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cxcl3Q6W5C0 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cxcl3Q6W5C0 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cxcl3Q6W5C0 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cxcl3Q6W5C0 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cxcl3Q6W5C0 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cxcl3Q6W5C0 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cxcl3Q6W5C0 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cxcl3Q6W5C0 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cxcl3Q6W5C0 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cxcl3Q6W5C0 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cxcl3Q6W5C0 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cxcl3Q6W5C0 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Cxcl3Q6W5C0 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cxcl3Q6W5C0 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Cxcl3Q6W5C0 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cxcl3Q6W5C0 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cxcl3Q6W5C0 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cxcl3Q6W5C0 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cxcl3Q6W5C0 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cxcl3Q6W5C0 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cxcl3Q6W5C0 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cxcl3Q6W5C0 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cxcl3Q6W5C0 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cxcl3Q6W5C0 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cxcl3Q6W5C0 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cxcl3Q6W5C0 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cxcl3Q6W5C0 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cxcl3Q6W5C0 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cxcl3Q6W5C0 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cxcl3Q6W5C0 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Cxcl3Q6W5C0 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Cxcl3Q6W5C0 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cxcl3Q6W5C0 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cxcl3Q6W5C0 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cxcl3Q6W5C0 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cxcl3Q6W5C0 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cxcl3Q6W5C0 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cxcl3Q6W5C0 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
Cxcl3Q6W5C0 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cxcl3Q6W5C0 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cxcl3Q6W5C0 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cxcl3Q6W5C0 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cxcl3Q6W5C0 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cxcl3Q6W5C0 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cxcl3Q6W5C0 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cxcl3Q6W5C0 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cxcl3Q6W5C0 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cxcl3Q6W5C0 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cxcl3Q6W5C0 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cxcl3Q6W5C0 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Cxcl3Q6W5C0 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cxcl3Q6W5C0 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cxcl3Q6W5C0 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cxcl3Q6W5C0 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cxcl3Q6W5C0 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cxcl3Q6W5C0 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cxcl3Q6W5C0 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cxcl3Q6W5C0 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cxcl3Q6W5C0 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cxcl3Q6W5C0 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Cxcl3Q6W5C0 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cxcl3Q6W5C0 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cxcl3Q6W5C0 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Cxcl3Q6W5C0 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Cxcl3Q6W5C0 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Cxcl3Q6W5C0 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Cxcl3Q6W5C0 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cxcl3Q6W5C0 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cxcl3Q6W5C0 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Cxcl3Q6W5C0 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Cxcl3Q6W5C0 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Cxcl3Q6W5C0 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Cxcl3Q6W5C0 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cxcl3Q6W5C0 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cxcl3Q6W5C0 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cxcl3Q6W5C0 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cxcl3Q6W5C0 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cxcl3Q6W5C0 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cxcl3Q6W5C0 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cxcl3Q6W5C0 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cxcl3Q6W5C0 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cxcl3Q6W5C0 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cxcl3Q6W5C0 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cxcl3Q6W5C0 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cxcl3Q6W5C0 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cxcl3Q6W5C0 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cxcl3Q6W5C0 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms