Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRU2

Tpm4, Tropomyosin alpha-4 chain, mousemouse

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Length 248 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm4Q6IRU2 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Tpm4Q6IRU2 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Tpm4Q6IRU2 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Tpm4Q6IRU2 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Tpm4Q6IRU2 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Tpm4Q6IRU2 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Tpm4Q6IRU2 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Tpm4Q6IRU2 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Tpm4Q6IRU2 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Tpm4Q6IRU2 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Tpm4Q6IRU2 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Tpm4Q6IRU2 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Tpm4Q6IRU2 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Tpm4Q6IRU2 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Tpm4Q6IRU2 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Tpm4Q6IRU2 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Tpm4Q6IRU2 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Tpm4Q6IRU2 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tpm4Q6IRU2 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Tpm4Q6IRU2 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tpm4Q6IRU2 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tpm4Q6IRU2 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tpm4Q6IRU2 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Tpm4Q6IRU2 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tpm4Q6IRU2 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tpm4Q6IRU2 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tpm4Q6IRU2 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tpm4Q6IRU2 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Tpm4Q6IRU2 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tpm4Q6IRU2 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tpm4Q6IRU2 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tpm4Q6IRU2 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tpm4Q6IRU2 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Tpm4Q6IRU2 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Tpm4Q6IRU2 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tpm4Q6IRU2 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tpm4Q6IRU2 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tpm4Q6IRU2 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tpm4Q6IRU2 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tpm4Q6IRU2 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tpm4Q6IRU2 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tpm4Q6IRU2 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tpm4Q6IRU2 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tpm4Q6IRU2 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tpm4Q6IRU2 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tpm4Q6IRU2 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tpm4Q6IRU2 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tpm4Q6IRU2 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tpm4Q6IRU2 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tpm4Q6IRU2 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tpm4Q6IRU2 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tpm4Q6IRU2 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tpm4Q6IRU2 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tpm4Q6IRU2 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tpm4Q6IRU2 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tpm4Q6IRU2 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tpm4Q6IRU2 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tpm4Q6IRU2 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tpm4Q6IRU2 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tpm4Q6IRU2 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tpm4Q6IRU2 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tpm4Q6IRU2 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tpm4Q6IRU2 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tpm4Q6IRU2 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Tpm4Q6IRU2 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tpm4Q6IRU2 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tpm4Q6IRU2 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tpm4Q6IRU2 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tpm4Q6IRU2 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tpm4Q6IRU2 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tpm4Q6IRU2 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tpm4Q6IRU2 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tpm4Q6IRU2 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tpm4Q6IRU2 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tpm4Q6IRU2 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tpm4Q6IRU2 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tpm4Q6IRU2 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tpm4Q6IRU2 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Tpm4Q6IRU2 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Tpm4Q6IRU2 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Tpm4Q6IRU2 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Tpm4Q6IRU2 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Tpm4Q6IRU2 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Tpm4Q6IRU2 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Tpm4Q6IRU2 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Tpm4Q6IRU2 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Tpm4Q6IRU2 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tpm4Q6IRU2 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tpm4Q6IRU2 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tpm4Q6IRU2 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tpm4Q6IRU2 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tpm4Q6IRU2 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tpm4Q6IRU2 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tpm4Q6IRU2 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tpm4Q6IRU2 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tpm4Q6IRU2 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tpm4Q6IRU2 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tpm4Q6IRU2 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tpm4Q6IRU2 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tpm4Q6IRU2 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
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